PHF10 (англ. PHD finger protein 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 051[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAAAGPGAA | | LSPRPCDSDP | | ATPGAQSPKD | | DNEDNSNDGT | | QPSKRRRMGS |
GDSSRSCETS | | SQDLGFSYYP | | AENLIEYKWP | | PDETGEYYML | | QEQVSEYLGV |
TSFKRKYPDL | | ERRDLSHKEK | | LYLRELNVIT | | ETQCTLGLTA | | LRSDEVIDLM |
IKEYPAKHAE | | YSVILQEKER | | QRITDHYKEY | | SQMQQQNTQK | | VEASKVPEYI |
KKAAKKAAEF | | NSNLNRERME | | ERRAYFDLQT | | HVIQVPQGKY | | KVLPTERTKV |
SSYPVALIPG | | QFQEYYKRYS | | PDELRYLPLN | | TALYEPPLDP | | ELPALDSDGD |
SDDGEDGRGD | | EKRKNKGTSD | | SSSGNVSEGE | | SPPDSQEDSF | | QGRQKSKDKA |
ATPRKDGPKR | | SVLSKSVPGY | | KPKVIPNAIC | | GICLKGKESN | | KKGKAESLIH |
CSQCENSGHP | | SCLDMTMELV | | SMIKTYPWQC | | MECKTCIICG | | QPHHEEEMMF |
CDMCDRGYHT | | FCVGLGAIPS | | GRWICDCCQR | | APPTPRKVGR | | RGKNSKEG |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|