POU4F3
POU4F3
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| POU4F3, BRN3C, DFNA15, POU class 4 homeobox 3, DFNA42, DFNA52 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602460 MGI: 102523 HomoloGene: 2023 GeneCards: POU4F3
|
---|
| Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal dominant nonsyndromic deafness 15, nonsyndromic deafness[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • слух • inner ear development • зір • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • диференціація клітин • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • vestibulocochlear nerve development • retinal ganglion cell axon guidance • inner ear morphogenesis • inner ear auditory receptor cell differentiation • axon extension • neuromuscular process controlling balance • neuron apoptotic process • inner ear receptor cell differentiation
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | | Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 5: 146.34 – 146.34 Mb
| Хр. 18: 42.53 – 42.53 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані | |
POU4F3 (англ. POU class 4 homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 37 052[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MMAMNSKQPF | | GMHPVLQEPK | | FSSLHSGSEA | | MRRVCLPAPQ | | LQGNIFGSFD |
ESLLARAEAL | | AAVDIVSHGK | | NHPFKPDATY | | HTMSSVPCTS | | TSSTVPISHP |
AALTSHPHHA | | VHQGLEGDLL | | EHISPTLSVS | | GLGAPEHSVM | | PAQIHPHHLG |
AMGHLHQAMG | | MSHPHTVAPH | | SAMPACLSDV | | ESDPRELEAF | | AERFKQRRIK |
LGVTQADVGA | | ALANLKIPGV | | GSLSQSTICR | | FESLTLSHNN | | MIALKPVLQA |
WLEEAEAAYR | | EKNSKPELFN | | GSERKRKRTS | | IAAPEKRSLE | | AYFAIQPRPS |
SEKIAAIAEK | | LDLKKNVVRV | | WFCNQRQKQK | | RMKYSAVH |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
|
|