PROFILPELAJAR.COM

PHF21A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2PUY, 2YQL
Ідентифікатори
Символи	PHF21A, BHC80, BM-006, PHD finger protein 21A, NEDMS, IDDBCS
Зовнішні ІД	OMIM: 608325 MGI: 2384756 HomoloGene: 9597 GeneCards: PHF21A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0031493 histone binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • histone deacetylase activity;
Клітинна компонента	• histone deacetylase complex; • DNA repair complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• зсідання крові; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • histone deacetylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51317
	192285
	ENSG00000135365
	ENSMUSG00000058318
	Q96BD5
	Q6ZPK0
NM_001101802; NM_016621; NM_001352025; NM_001352026; NM_001352027;
	NM_001352028; NM_001352029; NM_001352030; NM_001352031; NM_001352032
NM_001109690; NM_001109691; NM_138755; NM_001346704; NM_001362829;
	NM_001362830; NM_001362831; NM_001362832; NM_001362833
NP_001095272; NP_057705; NP_001338954; NP_001338955; NP_001338956;
	NP_001338957; NP_001338958; NP_001338959; NP_001338960; NP_001338961
NP_001103160; NP_001103161; NP_001333633; NP_620094; NP_001349758;
	NP_001349759; NP_001349760; NP_001349761; NP_001349762
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PHF21A (англ. PHD finger protein 21A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 680 амінокислот, а молекулярна маса — 74 854^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELQTLQEAL	KVEIQVHQKL	VAQMKQDPQN	ADLKKQLHEL	QAKITALSEK
QKRVVEQLRK	NLIVKQEQPD	KFQIQPLPQS	ENKLQTAQQQ	PLQQLQQQQQ
YHHHHAQQSA	AASPNLTASQ	KTVTTASMIT	TKTLPLVLKA	ATATMPASVV
GQRPTIAMVT	AINSQKAVLS	TDVQNTPVNL	QTSSKVTGPG	AEAVQIVAKN
TVTLVQATPP	QPIKVPQFIP	PPRLTPRPNF	LPQVRPKPVA	QNNIPIAPAP
PPMLAAPQLI	QRPVMLTKFT	PTTLPTSQNS	IHPVRVVNGQ	TATIAKTFPM
AQLTSIVIAT	PGTRLAGPQT	VQLSKPSLEK	QTVKSHTETD	EKQTESRTIT
PPAAPKPKRE	ENPQKLAFMV	SLGLVTHDHL	EEIQSKRQER	KRRTTANPVY
SGAVFEPERK	KSAVTYLNST	MHPGTRKRGR	PPKYNAVLGF	GALTPTSPQS
SHPDSPENEK	TETTFTFPAP	VQPVSLPSPT	STDGDIHEDF	CSVCRKSGQL
LMCDTCSRVY	HLDCLDPPLK	TIPKGMWICP	RCQDQMLKKE	EAIPWPGTLA
IVHSYIAYKA	AKEEEKQKLL	KWSSDLKQER	EQLEQKVKQL	SNSISKCMEM
KNTILARQKE	MHSSLEKVKQ	LIRLIHGIDL	SKPVDSEATV	GAISNGPDCT
PPANAATSTP	APSPSSQSCT	ANCNQGEETK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 DOI:10.1074/jbc.M208992200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24156 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96BD5 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24156 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q96BD5 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]