ZBTB21
Ідентифікатори
Символи
ZBTB21 , ZNF295, zinc finger and BTB domain containing 21
Зовнішні ІД
OMIM : 616485 MGI: 1927240 HomoloGene: 10799 GeneCards: ZBTB21
Онтологія гена
Молекулярна функція
• methyl-CpG binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 21: 41.99 – 42.01 Mb
Хр. 16: 97.74 – 97.76 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZBTB21 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 21 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 066 амінокислот , а молекулярна маса — 118 870[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEGLLHYINP AHAISLLSAL NEERLKGQLC DVLLIVGDQK FRAHKNVLAA
SSEYFQSLFT NKENESQTVF QLDFCEPDAF DNVLNYIYSS SLFVEKSSLA
AVQELGYSLG ISFLTNIVSK TPQAPFPTCP NRKKVFVEDD ENSSQKRSVI
VCQSRNEAQG KTVSQNQPDV SHTSRPSPSI AVKANTNKPH VPKPIEPLHN
LSLTEKSWPK DSSVVYAKSL EHSGSLDDPN RISLVKRNAV LPSKPLQDRE
AMDDKPGVSG QLPKGKALEL ALKRPRPPVL SVCSSSETPY LLKETNKGNG
QGEDRNLLYY SKLGLVIPSS GSGSGNQSID RSGPLVKSLL RRSLSMDSQV
PVYSPSIDLK SSQGSSSVSS DAPGNVLCAL SQKSSLKDCS EKTALDDRPQ
VLQPHRLRSF SASQSTDREG ASPVTEVRIK TEPSSPLSDP SDIIRVTVGD
AATTAAASSS SVTRDLSLKT EDDQKDMSRL PAKRRFQADR RLPFKKLKVN
EHGSPVSEDN FEEGSSPTLL DADFPDSDLN KDEFGELEGT RPNKKFKCKH
CLKIFRSTAG LHRHVNMYHN PEKPYACDIC HKRFHTNFKV WTHCQTQHGI
VKNPSPASSS HAVLDEKFQR KLIDIVRERE IKKALIIKLR RGKPGFQGQS
SSQAQQVIKR NLRSRAKGAY ICTYCGKAYR FLSQFKQHIK MHPGEKPLGV
NKVAKPKEHA PLASPVENKE VYQCRLCNAK LSSLLEQGSH ERLCRNAAVC
PYCSLRFFSP ELKQEHESKC EYKKLTCLEC MRTFKSSFSI WRHQVEVHNQ
NNMAPTENFS LPVLDHNGDV TGSSRPQSQP EPNKVNHIVT TKDDNVFSDS
SEQVNFDSED SSCLPEDLSL SKQLKIQVKE EPVEEAEEEA PEASTAPKEA
GPSKEASLWP CEKCGKMFTV HKQLERHQEL LCSVKPFICH VCNKAFRTNF
RLWSHFQSHM SQASEESAHK ESEVCPVPTN SPSPPPLPPP PPLPKIQPLE
PDSPTGLSEN PTPATEKLFV PQESDTLFYH APPLSAITFK RQFMCKLCHR
TFKTAFSLWS HEQTHN
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Wang J., Kudoh J., Takayanagi A., Shimizu N. (2005). Novel human BTB/POZ domain-containing zinc finger protein ZNF295 is directly associated with ZFP161. Biochem. Biophys. Res. Commun . 327 : 615—627. PMID 15629158 DOI :10.1016/j.bbrc.2004.12.048
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 111 : 12432—12437. PMID 25114211 DOI :10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші