KLF6
KLF6
Ідентифікатори
Символи
KLF6 , BCD1, CBA1, COPEB, CPBP, GBF, PAC1, ST12, ZF9, Kruppel-like factor 6, Kruppel like factor 6
Зовнішні ІД
OMIM : 602053 MGI: 1346318 HomoloGene: 996 GeneCards: KLF6
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding
Клітинна компонента
• fibrillar center • клітинне ядро • ядерце • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • B cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 10: 3.78 – 3.79 Mb
Хр. 13: 5.91 – 5.92 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
KLF6 (англ. Kruppel like factor 6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 283 амінокислот , а молекулярна маса — 31 865[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDVLPMCSIF QELQIVHETG YFSALPSLEE YWQQTCLELE RYLQSEPCYV
SASEIKFDSQ EDLWTKIILA REKKEESELK ISSSPPEDTL ISPSFCYNLE
TNSLNSDVSS ESSDSSEELS PTAKFTSDPI GEVLVSSGKL SSSVTSTPPS
SPELSREPSQ LWGCVPGELP SPGKVRSGTS GKPGDKGNGD ASPDGRRRVH
RCHFNGCRKV YTKSSHLKAH QRTHTGEKPY RCSWEGCEWR FARSDELTRH
FRKHTGAKPF KCSHCDRCFS RSDHLALHMK RHL
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
El Rouby S., Newcomb E.W. (1996). Identification of Bcd, a novel proto-oncogene expressed in B-cells. Oncogene . 13 : 2623—2630. PMID 9000136
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші