MYRF
MYRF
Ідентифікатори
Символи
MYRF , C11orf9, MRF, Ndt80, pqn-47, myelin regulatory factor, 11orf9, MMERV, CUGS
Зовнішні ІД
OMIM : 608329 MGI: 2684944 HomoloGene: 32167 GeneCards: MYRF
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• endoplasmic reticulum membrane • клітинне ядро • мембрана • цитоплазма • integral component of membrane • ендоплазматичний ретикулум • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі • гіалоплазма
Біологічний процес
• positive regulation of myelination • oligodendrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • протеоліз • central nervous system myelination • central nervous system myelin maintenance • диференціація клітин • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • oligodendrocyte development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein autoprocessing
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 11: 61.75 – 61.79 Mb
Хр. 19: 10.19 – 10.22 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MYRF (англ. Myelin regulatory factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 151 амінокислот , а молекулярна маса — 124 397[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEVVDETEAL QRFFEGHDIN GALEPSNIDT SILEEYISKE DASDLCFPDI
SAPASSASYS HGQPAMPGSS GVHHLSPPGG GPSPGRHGPL PPPGYGTPLN
CNNNNGMGAA PKPFPGGTGP PIKAEPKAPY APGTLPDSPP DSGSEAYSPQ
QVNEPHLLRT ITPETLCHVG VPSRLEHPPP PPAHLPGPPP PPPPPPHYPV
LQRDLYMKAE PPIPHYAAMG QGLVPTDLHH TQQSQMLHQL LQQHGAELPT
HPSKKRKHSE SPPSTLNAQM LNGMIKQEPG TVTALPLHPT RAPSPPWPPQ
GPLSPGPGSL PLSIARVQTP PWHPPGAPSP GLLQDSDSLS GSYLDPNYQS
IKWQPHQQNK WATLYDANYK ELPMLTYRVD ADKGFNFSVG DDAFVCQKKN
HFQVTVYIGM LGEPKYVKTP EGLKPLDCFY LKLHGVKLEA LNQSINIEQS
QSDRSKRPFN PVTVNLPPEQ VTKVTVGRLH FSETTANNMR KKGKPNPDQR
YFMLVVALQA HAQNQNYTLA AQISERIIVR ASNPGQFESD SDVLWQRAQV
PDTVFHHGRV GINTDRPDEA LVVHGNVKVM GSLMHPSDLR AKEHVQEVDT
TEQLKRISRM RLVHYRYKPE FAASAGIEAT APETGVIAQE VKEILPEAVK
DTGDMVFANG KTIENFLVVN KERIFMENVG AVKELCKLTD NLETRIDELE
RWSHKLAKLR RLDSLKSTGS SGAFSHAGSQ FSRAGSVPHK KRPPKVASKS
SSVVPDQACI SQRFLQGTII ALVVVMAFSV VSMSTLYVLS LRTEEDLVDT
DGSFAVSTSC LLALLRPQPP GGSEALCPWS SQSFGTTQLR QSPLTTGLPG
IQPSLLLVTT SLTSSAPGSA VRTLDMCSSH PCPVICCSSP TTNPTTGPSL
GPSFNPGHVL SPSPSPSTNR SGPSQMALLP VTNIRAKSWG LSVNGIGHSK
HHKSLEPLAS PAVPFPGGQG KAKNSPSLGF HGRARRGALQ SSVGPAEPTW
AQGQSASLLA EPVPSLTSIQ VLENSMSITS QYCAPGDACR PGNFTYHIPV
SSGTPLHLSL TLQMNSSSPV SVVLCSLRSK EEPCEEGSLP QSLHTHQDTQ
GTSHRWPITI LSFREFTYHF RVALLGQANC SSEALAQPAT DYHFHFYRLC
D
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз , протеаз , активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин , ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі , мембрані, ендоплазматичному ретикулумі .
Література
Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes. Genomics . 49 : 419—429. PMID 9615227 DOI :10.1006/geno.1998.5291
Li Z., Park Y., Marcotte E.M. (2013). A bacteriophage tailspike domain promotes self-cleavage of a human membrane-bound transcription factor, the myelin regulatory factor MYRF. PLoS Biol . 11 : E1001624—E1001624. PMID 23966832 DOI :10.1371/journal.pbio.1001624
Stoehr H., Marquardt A., White K., Weber B.H.F. (2000). cDNA cloning and genomic structure of a novel gene (C11orf9) localized to chromosome 11q12-->q13.1 which encodes a highly conserved, potential membrane-associated protein. Cytogenet. Cell Genet . 88 : 211—216. PMID 10828591
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші