PROFILPELAJAR.COM

ARID3A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KK0, 4LJX
Ідентифікатори
Символи	ARID3A, BRIGHT, DRIL1, DRIL3, E2FBP1, AT-rich interaction domain 3A
Зовнішні ІД	OMIM: 603265 MGI: 1328360 HomoloGene: 124247 GeneCards: ARID3A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • chromatin binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• membrane raft; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1820
	13496
	ENSG00000116017
	ENSMUSG00000019564
	Q99856
	Q62431
	NM_005224
	NM_001288625; NM_001288626; NM_007880
	NP_005215
	NP_001275554; NP_001275555; NP_031906
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARID3A (англ. AT-rich interaction domain 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 62 889^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKLQAVMETL	LQRQQRARQE	LEARQQLPPD	PPAAPPGRAR	AAPDEDREPE
SARMQRAQMA	ALAAMRAAAA	GLGHPASPGG	SEDGPPGSEE	EDAAREGTPG
SPGRGREGPG	EEHFEDMASD	EDMKPKWEEE	EMEEDLGEDE	EEEEEDYEDE
EEEEDEEGLG	PPGPASLGTT	ALFPRKAQPP	QAFRGDGVPR	VLGGQERPGP
GPAHPGGAAH	VAPQLQPPDH	GDWTYEEQFK	QLYELDGDPK	RKEFLDDLFS
FMQKRGTPVN	RIPIMAKQVL	DLFMLYVLVT	EKGGLVEVIN	KKLWREITKG
LNLPTSITSA	AFTLRTQYMK	YLYPYECEKR	GLSNPNELQA	AIDSNRREGR
RQSFGGSLFA	YSPGGAHGML	SSPKLPVSSL	GLAASTNGSS	ITPAPKIKKE
EDSAIPITVP	GRLPVSLAGH	PVVAAQAAAV	QAAAAQAAVA	AQAAALEQLR
EKLESAEPPE	KKMALVADEQ	QRLMQRALQQ	NFLAMAAQLP	MSIRINSQAS
ESRQDSAVNL	TGTNGSNSIS	MSVEINGIMY	TGVLFAQPPA	PTPTSAPNKG
GGGGGGSSSN	AGGRGGNTGT	SGGQAGPAGL	STPSTSTSNN	SLP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kim D., Probst L., Das C., Tucker P.W. (2007). REKLES is an ARID3-restricted multifunctional domain. J. Biol. Chem. 282: 15768—15777. PMID 17400556 DOI:10.1074/jbc.M700397200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3031 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017. {{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99856 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.