PROFILPELAJAR.COM

SMAD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1KHU, 2LAW, 2LAX, 2LAY, 2LAZ, 2LB0, 2LB1, 3Q47, 3Q4A
Ідентифікатори
Символи	SMAD1, BSP-1, BSP1, JV4-1, JV41, MADH1, MADR1, SMAD family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601595 MGI: 109452 HomoloGene: 21196 GeneCards: SMAD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • co-SMAD binding; • protein homodimerization activity; • I-SMAD binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • protein heterodimerization activity; • protein kinase binding; • sequence-specific DNA binding; • DEAD/H-box RNA helicase binding; • primary miRNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • SMAD protein complex; • гіалоплазма; • transcription regulator complex; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • nuclear inner membrane; • клітинне ядро; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus; • SMAD protein complex assembly; • ureteric bud development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • SMAD protein signal transduction; • embryonic pattern specification; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • hindbrain development; • cellular response to BMP stimulus; • cardiac muscle cell proliferation; • BMP signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • MAPK cascade; • protein phosphorylation; • gamete generation; • cartilage development; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of osteoblast differentiation; • positive regulation of cartilage development; • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing; • mesodermal cell fate commitment; • inflammatory response; • bone development; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • midbrain development; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • negative regulation of cell population proliferation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • osteoblast fate commitment; • homeostatic process; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • protein deubiquitination; • positive regulation of sprouting angiogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4086
	17125
	ENSG00000170365
	ENSMUSG00000031681
	Q15797
	P70340
	NM_001003688; NM_005900
	NM_008539
NP_001003688; NP_005891; NP_001341740; NP_001341741; NP_001341742;
	NP_001341743; NP_001341745; NP_001341746
	NP_032565
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMAD1 (англ. SMAD family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 260^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNVTSLFSFT	SPAVKRLLGW	KQGDEEEKWA	EKAVDALVKK	LKKKKGAMEE
LEKALSCPGQ	PSNCVTIPRS	LDGRLQVSHR	KGLPHVIYCR	VWRWPDLQSH
HELKPLECCE	FPFGSKQKEV	CINPYHYKRV	ESPVLPPVLV	PRHSEYNPQH
SLLAQFRNLG	QNEPHMPLNA	TFPDSFQQPN	SHPFPHSPNS	SYPNSPGSSS
STYPHSPTSS	DPGSPFQMPA	DTPPPAYLPP	EDPMTQDGSQ	PMDTNMMAPP
LPSEINRGDV	QAVAYEEPKH	WCSIVYYELN	NRVGEAFHAS	STSVLVDGFT
DPSNNKNRFC	LGLLSNVNRN	STIENTRRHI	GKGVHLYYVG	GEVYAECLSD
SSIFVQSRNC	NYHHGFHPTT	VCKIPSGCSL	KIFNNQEFAQ	LLAQSVNHGF
ETVYELTKMC	TIRMSFVKGW	GAEYHRQDVT	STPCWIEIHL	HGPLQWLDKV
LTQMGSPHNP	ISSVS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Lechleider R.J., de Caestecker M.P., Dehejia A., Polymeropoulos M.H., Roberts A.B. (1996). Serine phosphorylation, chromosomal localization, and transforming growth factor-beta signal transduction by human bsp-1. J. Biol. Chem. 271: 17617—17620. PMID 8663601 DOI:10.1074/jbc.271.30.17617
Zhang Y., Feng X.-H., Wu R.-Y., Derynck R. (1996). Receptor-associated Mad homologues synergize as effectors of the TGF-beta response. Nature. 383: 168—172. PMID 8774881 DOI:10.1038/383168a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kretzschmar M., Liu F., Hata A., Doody J., Massague J. (1997). The TGF-beta family mediator Smad1 is phosphorylated directly and activated functionally by the BMP receptor kinase. Genes Dev. 11: 984—995. PMID 9136927 DOI:10.1101/gad.11.8.984
Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 DOI:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00012-X