PROFILPELAJAR.COM

NR1H2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1P8D, 1PQ6, 1PQ9, 1PQC, 1UPV, 1UPW, 3KFC, 3L0E, 4DK7, 4DK8, 4RAK, 5HJP, 4NQA, 5I4V,%%s4NQA
Ідентифікатори
Символи	NR1H2, LXR-b, LXRB, NER, NER-I, RIP15, UNR, Liver X receptor beta, nuclear receptor subfamily 1 group H member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600380 MGI: 1352463 HomoloGene: 21397 GeneCards: NR1H2
Реагує на сполуку
	(25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • ATPase binding; • zinc ion binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з іоном металу; • retinoid X receptor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • steroid hormone receptor activity; • apolipoprotein A-I receptor binding; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• positive regulation of high-density lipoprotein particle assembly; • negative regulation of proteolysis; • positive regulation of triglyceride biosynthetic process; • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process; • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway; • positive regulation of cholesterol transport; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cellular lipid metabolic process; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of secretion of lysosomal enzymes; • positive regulation of lipid storage; • positive regulation of lipoprotein lipase activity; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of fatty acid biosynthetic process; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cholesterol storage; • negative regulation of pinocytosis; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • retinoic acid receptor signaling pathway; • positive regulation of cholesterol efflux; • positive regulation of pancreatic juice secretion; • lipid homeostasis; • negative regulation of lipid transport; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • steroid hormone mediated signaling pathway; • cholesterol homeostasis; • lipid metabolism; • multicellular organism development; • диференціація клітин; • cellular response to lipopolysaccharide; • negative regulation of cold-induced thermogenesis; • intracellular receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7376
	22260
	ENSG00000131408
	ENSMUSG00000060601
	P55055
	Q60644
	NM_007121; NM_001256647
	NM_001285517; NM_001285518; NM_001285519; NM_009473
	NP_001243576; NP_009052; NP_009052.3
	NP_001272446; NP_001272447; NP_001272448; NP_033499
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR1H2 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 460 амінокислот, а молекулярна маса — 50 974^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSPTTSSLD	TPLPGNGPPQ	PGAPSSSPTV	KEEGPEPWPG	GPDPDVPGTD
EASSACSTDW	VIPDPEEEPE	RKRKKGPAPK	MLGHELCRVC	GDKASGFHYN
VLSCEGCKGF	FRRSVVRGGA	RRYACRGGGT	CQMDAFMRRK	CQQCRLRKCK
EAGMREQCVL	SEEQIRKKKI	RKQQQESQSQ	SQSPVGPQGS	SSSASGPGAS
PGGSEAGSQG	SGEGEGVQLT	AAQELMIQQL	VAAQLQCNKR	SFSDQPKVTP
WPLGADPQSR	DARQQRFAHF	TELAIISVQE	IVDFAKQVPG	FLQLGREDQI
ALLKASTIEI	MLLETARRYN	HETECITFLK	DFTYSKDDFH	RAGLQVEFIN
PIFEFSRAMR	RLGLDDAEYA	LLIAINIFSA	DRPNVQEPGR	VEALQQPYVE
ALLSYTRIKR	PQDQLRFPRM	LMKLVSLRTL	SSVHSEQVFA	LRLQDKKLPP
LLSEIWDVHE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504