ZNF143
Ідентифікатори
Символи
ZNF143 , SBF, STAF, pHZ-1, zinc finger protein 143
Зовнішні ІД
OMIM : 603433 MGI: 1277969 HomoloGene: 56444 GeneCards: ZNF143
Онтологія гена
Молекулярна функція
• nucleic acid binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of transcription by RNA polymerase III • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • snRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 11: 9.46 – 9.53 Mb
Хр. 7: 109.66 – 109.69 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZNF143 (англ. Zinc finger protein 143 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 638 амінокислот , а молекулярна маса — 68 896[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLLAQINRDS QGMTEFPGGG MEAQHVTLCL TEAVTVADGD NLENMEGVSL
QAVTLADGST AYIQHNSKDA KLIDGQVIQL EDGSAAYVQH VPIPKSTGDS
LRLEDGQAVQ LEDGTTAFIH HTSKDSYDQS ALQAVQLEDG TTAYIHHAVQ
VPQSDTILAI QADGTVAGLH TGDATIDPDT ISALEQYAAK VSIDGSESVA
GTGMIGENEQ EKKMQIVLQG HATRVTAKSQ QSGEKAFRCE YDGCGKLYTT
AHHLKVHERS HTGDRPYQCE HAGCGKAFAT GYGLKSHVRT HTGEKPYRCS
EDNCTKSFKT SGDLQKHIRT HTGERPFKCP FEGCGRSFTT SNIRKVHVRT
HTGERPYYCT EPGCGRAFAS ATNYKNHVRI HTGEKPYVCT VPGCDKRFTE
YSSLYKHHVV HTHSKPYNCN HCGKTYKQIS TLAMHKRTAH NDTEPIEEEQ
EAFFEPPPGQ GEDVLKGSQI TYVTGVEGDD VVSTQVATVT QSGLSQQVTL
ISQDGTQHVN ISQADMQAIG NTITMVTQDG TPITVPAHDA VISSAGTHSV
AMVTAEGTEG EQVAIVAQDL AAFHTASSEM GHQQHSHHLV TTETRPLTLV
ATSNGTQIAV QLGEQPSLEE AIRIASRIQQ GETPGLDD
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Tommerup N., Vissing H. (1995). Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger-encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders. Genomics . 27 : 259—264. PMID 7557990 doi :10.1006/geno.1995.1040
Rincon J.C., Engler S.K., Hargrove B.W., Kunkel G.R. (1998). Molecular cloning of a cDNA encoding human SPH-binding factor, a conserved protein that binds to the enhancer-like region of the U6 small nuclear RNA gene promoter. Nucleic Acids Res . 26 : 4846—4852. PMID 9776743 doi :10.1093/nar/26.21.4846
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
Information related to ZNF143