SP8
Ідентифікатори
Символи
SP8 , BTD, Sp8 transcription factor
Зовнішні ІД
OMIM : 608306 MGI: 2443471 HomoloGene: 18548 GeneCards: SP8
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• proximal/distal pattern formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • dorsal/ventral pattern formation • embryonic limb morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 20.78 – 20.79 Mb
Хр. 12: 118.81 – 118.82 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
SP8 (англ. Sp8 transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот , а молекулярна маса — 48 674[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLAATCNKIG SPSPSPSSLS DSSSSFGKGF HPWKRSSSSS SASCNVVGSS
LSSFGVSGAS RNGGSSSAAA AAAAAAAAAA ALVSDSFSCG GSPGSSAFSL
TSSSAAAAAA AAAAAASSSP FANDYSVFQA PGVSGGSGGG GGGGGGGSSA
HSQDGSHQPV FISKVHTSVD GLQGIYPRVG MAHPYESWFK PSHPGLGAAG
EVGSAGASSW WDVGAGWIDV QNPNSAAALP GSLHPAAGGL QTSLHSPLGG
YNSDYSGLSH SAFSSGASSH LLSPAGQHLM DGFKPVLPGS YPDSAPSPLA
GAGGSMLSAG PSAPLGGSPR SSARRYSGRA TCDCPNCQEA ERLGPAGASL
RRKGLHSCHI PGCGKVYGKT SHLKAHLRWH TGERPFVCNW LFCGKRFTRS
DELQRHLRTH TGEKRFACPV CNKRFMRSDH LSKHVKTHSG GGGGGGSAGS
GSGGKKGSDT DSEHSAAGSP PCHSPELLQP PEPGHRNGLE
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Milona M.-A., Gough J.E., Edgar A.J. (2004). Genomic structure and cloning of two transcript isoforms of human Sp8. BMC Genomics . 5 : 86—86. PMID 15533246 DOI :10.1186/1471-2164-5-86
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші