ZNF19
Ідентифікатори
Символи
ZNF19 , KOX12, zinc finger protein 19
Зовнішні ІД
OMIM : 194525 HomoloGene: 56009 GeneCards: ZNF19
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 71.46 – 71.57 Mb
н/д
PubMed search
[ 1]
н/д Вікідані
ZNF19 (англ. Zinc finger protein 19 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[ 2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот , а молекулярна маса — 52 449[ 3] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAMPLKAQY QEMVTFEDVA VHFTKTEWTG LSPAQRALYR SVMLENFGNL
TALGYPVPKP ALISLLERGD MAWGLEAQDD PPAERTKNVC KDVETNIDSE
STLIQGISEE RDGMMSHGQL KSVPQRTDFP ETRNVEKHQD IPTVKNIQGK
VPRIPCARKP FICEECGKSF SYFSYYARHQ RIHTGEKPFE CSECGKAFNG
NSSLIRHQRI HTGERPYQCE ECGRAFNDNA NLIRHQRIHS GDRPYYCTEC
GNSFTSSSEF VIHQRIHTGE KPYECNECGK AFVGNSPLLR HQKIHTGEKP
YECNECGKSF GRTSHLSQHQ RIHTGEKPYS CKVCGQAFNF HTKLTRHQRI
HSEEKPFDCV DCGKAFSAQE QLKRHLRIHT QESSYVCDEC GKALTSKRNL
HQHQRIHTGE KPYECSKYEK AFGTSSQLGH LEHVYSGEKP VLDICRFGLP
EFFTPFYW
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Bray P.L., Lichter P., Thiesen H.-J., Ward D.C., Dawid I.B. (1991). Characterization and mapping of human genes encoding zinc finger proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 88 : 9563—9567. PMID 1946370 DOI :10.1073/pnas.88.21.9563
Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells. New Biol . 2 : 363—374. PMID 2288909
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші