E2F4
E2F4
Ідентифікатори
Символи
E2F4 , E2F-4, E2F transcription factor 4
Зовнішні ІД
OMIM : 600659 MGI: 103012 HomoloGene: 1471 GeneCards: E2F4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • promoter-specific chromatin binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• regulation of cell size • epithelial cell development • cell volume homeostasis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multi-ciliated epithelial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • кровообіг • cell projection organization • regulation of cell population proliferation • animal organ morphogenesis • клітинний цикл • motile cilium assembly • centriole assembly • transcription, DNA-templated • GO:0007067 мітоз • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cilium assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 67.19 – 67.2 Mb
Хр. 8: 106.02 – 106.03 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
E2F4 (англ. E2F transcription factor 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 413 амінокислот , а молекулярна маса — 43 960[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAEAGPQAPP PPGTPSRHEK SLGLLTTKFV SLLQEAKDGV LDLKLAADTL
AVRQKRRIYD ITNVLEGIGL IEKKSKNSIQ WKGVGPGCNT REIADKLIEL
KAEIEELQQR EQELDQHKVW VQQSIRNVTE DVQNSCLAYV THEDICRCFA
GDTLLAIRAP SGTSLEVPIP EGLNGQKKYQ IHLKSVSGPI EVLLVNKEAW
SSPPVAVPVP PPEDLLQSPS AVSTPPPLPK PALAQSQEAS RPNSPQLTPT
AVPGSAEVQG MAGPAAEITV SGGPGTDSKD SGELSSLPLG PTTLDTRPLQ
SSALLDSSSS SSSSSSSSSN SNSSSSSGPN PSTSFEPIKA DPTGVLELPK
ELSEIFDPTR ECMSSELLEE LMSSEVFAPL LRLSPPPGDH DYIYNLDESE
GVCDLFDVPV LNL
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , клітинний цикл , біогенез та деградація війок, ацетилювання .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Schwemmle S., Pfeifer G.P. (2000). Genomic structure and mutation screening of the E2F4 gene in human tumors. Int. J. Cancer . 86 : 672—677. PMID 10797289 DOI :10.1002/(SICI)1097-0215(20000601)86:5<672::AID-IJC11>3.0.CO;2-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Williams C.D., Linch D.C., Soerensen T.S., La Thangue N.B., Thomas N.S.B. (1997). The predominant E2F complex in human primary haemopoietic cells and in AML blasts contains E2F-4, DP-1 and p130 . Br. J. Haematol . 96 : 688—696. PMID 9074408 DOI :10.1046/j.1365-2141.1997.d01-2086.x
Lang S.E., McMahon S.B., Cole M.D., Hearing P. (2001). E2F transcriptional activation requires TRRAP and GCN5 cofactors. J. Biol. Chem . 276 : 32627—32634. PMID 11418595 DOI :10.1074/jbc.M102067200
Luciano R.L., Wilson A.C. (2003). HCF-1 functions as a coactivator for the zinc finger protein Krox20. J. Biol. Chem . 278 : 51116—51124. PMID 14532282 DOI :10.1074/jbc.M303470200
Wang G.L., Iakova P., Wilde M., Awad S., Timchenko N.A. (2004). Liver tumors escape negative control of proliferation via PI3K/Akt-mediated block of C/EBP alpha growth inhibitory activity. Genes Dev . 18 : 912—925. PMID 15107404 DOI :10.1101/gad.1183304
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші