RBL1
RBL1
Ідентифікатори
Символи
RBL1 , CP107, PRB1, p107, retinoblastoma-like 1, RB transcriptional corepressor like 1
Зовнішні ІД
OMIM : 116957 MGI: 103300 HomoloGene: 2172 GeneCards: RBL1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • Хроматин
Біологічний процес
• regulation of cell cycle • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid kinase activity • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • negative regulation of cellular senescence • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • regulation of mitotic cell cycle • диференціація клітин • regulation of cell division • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 20: 37 – 37.1 Mb
Хр. 2: 156.99 – 157.05 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
RBL1 (англ. RB transcriptional corepressor like 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот , а молекулярна маса — 120 847[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MFEDKPHAEG AAVVAAAGEA LQALCQELNL DEGSAAEALD DFTAIRGNYS
LEGEVTHWLA CSLYVACRKS IIPTVGKGIM EGNCVSLTRI LRSAKLSLIQ
FFSKMKKWMD MSNLPQEFRE RIERLERNFE VSTVIFKKYE PIFLDIFQNP
YEEPPKLPRS RKQRRIPCSV KDLFNFCWTL FVYTKGNFRM IGDDLVNSYH
LLLCCLDLIF ANAIMCPNRQ DLLNPSFKGL PSDFHTADFT ASEEPPCIIA
VLCELHDGLL VEAKGIKEHY FKPYISKLFD RKILKGECLL DLSSFTDNSK
AVNKEYEEYV LTVGDFDERI FLGADAEEEI GTPRKFTRDT PLGKLTAQAN
VEYNLQQHFE KKRSFAPSTP LTGRRYLREK EAVITPVASA TQSVSRLQSI
VAGLKNAPSD QLINIFESCV RNPVENIMKI LKGIGETFCQ HYTQSTDEQP
GSHIDFAVNR LKLAEILYYK ILETVMVQET RRLHGMDMSV LLEQDIFHRS
LMACCLEIVL FAYSSPRTFP WIIEVLNLQP FYFYKVIEVV IRSEEGLSRD
MVKHLNSIEE QILESLAWSH DSALWEALQV SANKVPTCEE VIFPNNFETG
NGGNVQGHLP LMPMSPLMHP RVKEVRTDSG SLRRDMQPLS PISVHERYSS
PTAGSAKRRL FGEDPPKEML MDKIITEGTK LKIAPSSSIT AENVSILPGQ
TLLTMATAPV TGTTGHKVTI PLHGVANDAG EITLIPLSMN TNQESKVKSP
VSLTAHSLIG ASPKQTNLTK AQEVHSTGIN RPKRTGSLAL FYRKVYHLAS
VRLRDLCLKL DVSNELRRKI WTCFEFTLVH CPDLMKDRHL DQLLLCAFYI
MAKVTKEERT FQEIMKSYRN QPQANSHVYR SVLLKSIPRE VVAYNKNIND
DFEMIDCDLE DATKTPDCSS GPVKEERGDL IKFYNTIYVG RVKSFALKYD
LANQDHMMDA PPLSPFPHIK QQPGSPRRIS QQHSIYISPH KNGSGLTPRS
ALLYKFNGSP SKSLKDINNM IRQGEQRTKK RVIAIDSDAE SPAKRVCQEN
DDVLLKRLQD VVSERANH
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , регуляторів хроматину , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус , транскрипція , регуляція транскрипції , клітинний цикл , альтернативний сплайсинг .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Ewen M.E., Xing Y., Lawrence J.B., Livingston D.M. (1991). Molecular cloning, chromosomal mapping, and expression of the cDNA for p107, a retinoblastoma gene product-related protein. Cell . 66 : 1155—1164. PMID 1833063 DOI :10.1016/0092-8674(91)90038-Z
Zhu L., Zhu L., Xie E., Chang L.S. (1995). Differential roles of two tandem E2F sites in repression of the human p107 promoter by retinoblastoma and p107 proteins . Mol. Cell. Biol . 15 : 3552—3562. PMID 7791762 DOI :10.1128/MCB.15.7.3552
Leng X., Noble M., Adams P.D., Qin J., Harper J.W. (2002). Reversal of growth suppression by p107 via direct phosphorylation by cyclin D1/cyclin-dependent kinase 4 . Mol. Cell. Biol . 22 : 2242—2254. PMID 11884610 DOI :10.1128/MCB.22.7.2242-2254.2002
Dyson N., Buchkovich K., Whyte P., Harlow E. (1989). The cellular 107K protein that binds to adenovirus E1A also associates with the large T antigens of SV40 and JC virus. Cell . 58 : 249—255. PMID 2546678 DOI :10.1016/0092-8674(89)90839-8
Kim Y.W., Otterson G.A., Kratzke R.A., Coxon A.B., Kaye F.J. (1994). Differential specificity for binding of retinoblastoma binding protein 2 to RB, p107, and TATA-binding protein . Mol. Cell. Biol . 14 : 7256—7264. PMID 7935440 DOI :10.1128/MCB.14.11.7256
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші