RFX6
RFX6
Ідентифікатори
Символи
RFX6 , MTCHRS, MTFS, RFXDC1, dJ955L16.1, regulatory factor X6
Зовнішні ІД
OMIM : 612659 MGI: 2445208 HomoloGene: 18318 GeneCards: RFX6
Пов'язані генетичні захворювання
Mitchell-Riley syndrome [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• клітинне ядро • ядерце
Біологічний процес
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • pancreatic epsilon cell differentiation • glucose homeostasis • regulation of insulin secretion • pancreatic A cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • type B pancreatic cell differentiation • pancreatic D cell differentiation • endocrine pancreas development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 116.88 – 116.93 Mb
Хр. 10: 51.55 – 51.61 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
RFX6 (англ. Regulatory factor X6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 928 амінокислот , а молекулярна маса — 102 461[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAKVPELEDT FLQAQPAPQL SPGIQEDCCV QLLGKGLLVY PEETVYLAAE
GQPGGEQGGG EKGEDPELPG AVKSEMHLNN GNFSSEEEDA DNHDSKTKAA
DQYLSQKKTI TQIVKDKKKQ TQLTLQWLEE NYIVCEGVCL PRCILYAHYL
DFCRKEKLEP ACAATFGKTI RQKFPLLTTR RLGTRGHSKY HYYGIGIKES
SAYYHSVYSG KGLTRFSGSK LKNEGGFTRK YSLSSKTGTL LPEFPSAQHL
VYQGCISKDK VDTLIMMYKT HCQCILDNAI NGNFEEIQHF LLHFWQGMPD
HLLPLLENPV IIDIFCVCDS ILYKVLTDVL IPATMQEMPE SLLADIRNFA
KNWEQWVVSS LENLPEALTD KKIPIVRRFV SSLKRQTSFL HLAQIARPAL
FDQHVVNSMV SDIERVDLNS IGSQALLTIS GSTDTESGIY TEHDSITVFQ
ELKDLLKKNA TVEAFIEWLD TVVEQRVIKT SKQNGRSLKK RAQDFLLKWS
FFGARVMHNL TLNNASSFGS FHLIRMLLDE YILLAMETQF NNDKEQELQN
LLDKYMKNSD ASKAAFTASP SSCFLANRNK GSMVSSDAVK NESHVETTYL
PLPSSQPGGL GPALHQFPAG NTDNMPLTGQ MELSQIAGHL MTPPISPAMA
SRGSVINQGP MAGRPPSVGP VLSAPSHCST YPEPIYPTLP QANHDFYSTS
SNYQTVFRAQ PHSTSGLYPH HTEHGRCMAW TEQQLSRDFF SGSCAGSPYN
SRPPSSYGPS LQAQDSHNMQ FLNTGSFNFL SNTGAASCQG ATLPPNSPNG
YYGSNINYPE SHRLGSMVNQ HVSVISSIRS LPPYSDIHDP LNILDDSGRK
QTSSFYTDTS SPVACRTPVL ASSLQTPIPS SSSQCMYGTS NQYPAQETLD
SHGTSSREMV SSLPPINTVF MGTAAGGT
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Aftab S., Semenec L., Chu J.S.-C., Chen N. (2008). Identification and characterization of novel human tissue-specific RFX transcription factors. BMC Evol. Biol . 8 : 226—226. PMID 18673564 DOI :10.1186/1471-2148-8-226
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші