MEIS2
MEIS2
Ідентифікатори
Символи
MEIS2 , HsT18361, MRG1, Meis homeobox 2, CPCMR
Зовнішні ІД
OMIM : 601740 MGI: 108564 HomoloGene: 7846 GeneCards: MEIS2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро
Біологічний процес
• розвиток ока • visual learning • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to mechanical stimulus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • pancreas development • response to growth factor • negative regulation of myeloid cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of cardiac muscle myoblast proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 15: 36.89 – 37.1 Mb
Хр. 2: 115.69 – 115.9 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MEIS2 (англ. Meis homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 477 амінокислот , а молекулярна маса — 51 790[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAQRYDELPH YGGMDGVGVP ASMYGDPHAP RPIPPVHHLN HGPPLHATQH
YGAHAPHPNV MPASMGSAVN DALKRDKDAI YGHPLFPLLA LVFEKCELAT
CTPREPGVAG GDVCSSDSFN EDIAVFAKQV RAEKPLFSSN PELDNLMIQA
IQVLRFHLLE LEKVHELCDN FCHRYISCLK GKMPIDLVID ERDGSSKSDH
EELSGSSTNL ADHNPSSWRD HDDATSTHSA GTPGPSSGGH ASQSGDNSSE
QGDGLDNSVA SPGTGDDDDP DKDKKRQKKR GIFPKVATNI MRAWLFQHLT
HPYPSEEQKK QLAQDTGLTI LQVNNWFINA RRRIVQPMID QSNRAGFLLD
PSVSQGAAYS PEGQPMGSFV LDGQQHMGIR PAGLQSMPGD YVSQGGPMGM
SMAQPSYTPP QMTPHPTQLR HGPPMHSYLP SHPHHPAMMM HGGPPTHPGM
TMSAQSPTML NSVDPNVGGQ VMDIHAQ
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Smith J.E. Jr., Afonja O., Yee H.T., Inghirami G., Takeshita K. (1997). Chromosomal mapping to 15q14 and expression analysis of the human MEIS2 homeobox gene. Mamm. Genome . 8 : 951—952. PMID 9383298 DOI :10.1007/s003359900621
Liu Y., MacDonald R.J., Swift G.H. (2001). DNA binding and transcriptional activation by a PDX1.PBX1b.MEIS2b trimer and cooperation with a pancreas-specific basic helix-loop-helix complex. J. Biol. Chem . 276 : 17985—17993. PMID 11279116 DOI :10.1074/jbc.M100678200
Hyman-Walsh C., Bjerke G.A., Wotton D. (2010). An autoinhibitory effect of the homothorax domain of Meis2. FEBS J. 277 : 2584—2597. PMID 20553494 DOI :10.1111/j.1742-4658.2010.07668.x
Bjerke G.A., Hyman-Walsh C., Wotton D. (2011). Cooperative transcriptional activation by Klf4, Meis2, and Pbx1. Mol. Cell. Biol . 31 : 3723—3733. PMID 21746878 DOI :10.1128/MCB.01456-10
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші