FOXN3
FOXN3
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| FOXN3, C14orf116, CHES1, PRO1635, forkhead box N3 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 602628 HomoloGene: 3809 GeneCards: FOXN3
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• клітинний цикл • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • craniofacial suture morphogenesis • диференціація клітин • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | | Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 14: 89.12 – 89.62 Mb
| н/д
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані | |
FOXN3 (англ. Forkhead box N3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 53 835[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGPVMPPSKK | | PESSGISVSS | | GLSQCYGGSG | | FSKALQEDDD | | LDFSLPDIRL |
EEGAMEDEEL | | TNLNWLHESK | | NLLKSFGESV | | LRSVSPVQDL | | DDDTPPSPAH |
SDMPYDARQN | | PNCKPPYSFS | | CLIFMAIEDS | | PTKRLPVKDI | | YNWILEHFPY |
FANAPTGWKN | | SVRHNLSLNK | | CFKKVDKERS | | QSIGKGSLWC | | IDPEYRQNLI |
QALKKTPYHP | | HPHVFNTPPT | | CPQAYQSTSG | | PPIWPGSTFF | | KRNGALLQDP |
DIDAASAMML | | LNTPPEIQAG | | FPPGVIQNGA | | RVLSRGLFPG | | VRPLPITPIG |
VTAAMRNGIT | | SCRMRTESEP | | SCGSPVVSGD | | PKEDHNYSSA | | KSSNARSTSP |
TSDSISSSSS | | SADDHYEFAT | | KGSQEGSEGS | | EGSFRSHESP | | SDTEEDDRKH |
SQKEPKDSLG | | DSGYASQHKK | | RQHFAKARKV | | PSDTLPLKKR | | RTEKPPESDD |
EEMKEAAGSL | | LHLAGIRSCL | | NNITNRTAKG | | QKEQKETTKN |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
|
|