MYT1
MYT1
Ідентифікатори
Символи
MYT1 , C20orf36, MTF1, MYTI, NZF2, PLPB1, ZC2HC4A, ZC2H2C1, myelin transcription factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 600379 MGI: 1100535 HomoloGene: 3332 GeneCards: MYT1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• multicellular organism development • нейробіологія розвитку • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • диференціація клітин • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 20: 64.1 – 64.24 Mb
Хр. 2: 181.76 – 181.83 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MYT1 (англ. Myelin transcription factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 121 амінокислот , а молекулярна маса — 122 329[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSLENEDKRA RTRSKALRGP PETTAADLSC PTPGCTGSGH VRGKYSRHRS
LQSCPLAKKR KLEGAEAEHL VSKRKSHPLK LALDEGYGVD SDGSEDTEVK
DASVSDESEG TLEGAEAETS GQDEIHRPET AEGRSPVKSH FGSNPIGSAT
ASSKGSYSSY QGIIATSLLN LGQIAEETLV EEDLGQAAKP GPGIVHLLQE
AAEGAASEEG EKGLFIQPED AEEVVEVTTE RSQDLCPQSL EDAASEESSK
QKGILSHEEE DEEEEEEEEE EEEDEEEEEE EEEEEEEEEE EEEEEEEEEE
EEEEEEAAPD VIFQEDTSHT SAQKAPELRG PESPSPKPEY SVIVEVRSDD
DKDEDTHSRK STVTDESEMQ DMMTRGNLGL LEQAIALKAE QVRTVCEPGC
PPAEQSQLGL GEPGKAAKPL DTVRKSYYSK DPSRAEKREI KCPTPGCDGT
GHVTGLYPHH RSLSGCPHKD RIPPEILAMH ENVLKCPTPG CTGQGHVNSN
RNTHRSLSGC PIAAAEKLAK SHEKQQPQTG DPSKSSSNSD RILRPMCFVK
QLEVPPYGSY RPNVAPATPR ANLAKELEKF SKVTFDYASF DAQVFGKRML
APKIQTSETS PKAFQCFDYS QDAEAAHMAA TAILNLSTRC WEMPENLSTK
PQDLPSKSVD IEVDENGTLD LSMHKHRKRE NAFPSSSSCS SSPGVKSPDA
SQRHSSTSAP SSSMTSPQSS QASRQDEWDR PLDYTKPSRL REEEPEESEP
AAHSFASSEA DDQEVSEENF EERKYPGEVT LTNFKLKFLS KDIKKELLTC
PTPGCDGSGH ITGNYASHRS LSGCPLADKS LRNLMAAHSA DLKCPTPGCD
GSGHITGNYA SHRSLSGCPR AKKSGVKVAP TKDDKEDPEL MKCPVPGCVG
LGHISGKYAS HRSASGCPLA ARRQKEGSLN GSSFSWKSLK NEGPTCPTPG
CDGSGHANGS FLTHRSLSGC PRATFAGKKG KLSGDEVLSP KFKTSDVLEN
DEEIKQLNQE IRDLNESNSE MEAAMVQLQS QISSMEKNLK NIEEENKLIE
EQNEALFLEL SGLSQALIQS LANIRLPHME PICEQNFDAY VSTLTDMYSN
QDPENKDLLE SIKQAVRGIQ V
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин , нейрогенез , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Kim J.G., Hudson L.D. (1992). Novel member of the zinc finger superfamily: a C2-HC finger that recognizes a glia-specific gene . Mol. Cell. Biol . 12 : 5632—5639. PMID 1280325 DOI :10.1128/MCB.12.12.5632
Armstrong R.C., Kim J.G., Hudson L.D. (1995). Expression of myelin transcription factor I (MyTI), a 'zinc-finger' DNA-binding protein, in developing oligodendrocytes. Glia . 14 : 303—321. PMID 8530187 DOI :10.1002/glia.440140407
Nielsen J.A., Berndt J.A., Hudson L.D., Armstrong R.C. (2004). Myelin transcription factor 1 (Myt1) modulates the proliferation and differentiation of oligodendrocyte lineage cells. Mol. Cell. Neurosci . 25 : 111—123. PMID 14962745 DOI :10.1016/j.mcn.2003.10.001
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші