TFCP2
TFCP2
Ідентифікатори
Символи
TFCP2 , LBP1C, LSF, LSF1D, SEF, TFCP2C, transcription factor CP2
Зовнішні ІД
OMIM : 189889 MGI: 98509 HomoloGene: 4134 GeneCards: TFCP2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • mRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 51.09 – 51.17 Mb
Хр. 15: 100.4 – 100.45 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TFCP2 (англ. Transcription factor CP2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот , а молекулярна маса — 57 256[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAWALKLPLA DEVIESGLVQ DFDASLSGIG QELGAGAYSM SDVLALPIFK
QEESSLPPDN ENKILPFQYV LCAATSPAVK LHDETLTYLN QGQSYEIRML
DNRKLGELPE INGKLVKSIF RVVFHDRRLQ YTEHQQLEGW RWNRPGDRIL
DIDIPMSVGI IDPRANPTQL NTVEFLWDPA KRTSVFIQVH CISTEFTMRK
HGGEKGVPFR VQIDTFKENE NGEYTEHLHS ASCQIKVFKP KGADRKQKTD
REKMEKRTPH EKEKYQPSYE TTILTECSPW PEITYVNNSP SPGFNSSHSS
FSLGEGNGSP NHQPEPPPPV TDNLLPTTTP QEAQQWLHRN RFSTFTRLFT
NFSGADLLKL TRDDVIQICG PADGIRLFNA LKGRMVRPRL TIYVCQESLQ
LREQQQQQQQ QQQKHEDGDS NGTFFVYHAI YLEELTAVEL TEKIAQLFSI
SPCQISQIYK QGPTGIHVLI SDEMIQNFQE EACFILDTMK AETNDSYHII
LK
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Lim L.C., Swendeman S.L., Sheffery M. (1992). Molecular cloning of the alpha-globin transcription factor CP2 . Mol. Cell. Biol . 12 : 828—835. PMID 1732747 DOI :10.1128/MCB.12.2.828
Yoon J.-B., Li G., Roeder R.G. (1994). Characterization of a family of related cellular transcription factors which can modulate human immunodeficiency virus type 1 transcription in vitro . Mol. Cell. Biol . 14 : 1776—1785. PMID 8114710 DOI :10.1128/MCB.14.3.1776
Shirra M.K., Zhu Q., Huang H.-C., Pallas D., Hansen U. (1994). One exon of the human LSF gene includes conserved regions involved in novel DNA-binding and dimerization motifs . Mol. Cell. Biol . 14 : 5076—5087. PMID 8035790 DOI :10.1128/MCB.14.8.5076
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Bing Z., Reddy S.A., Ren Y., Qin J., Liao W.S.-L. (1999). Purification and characterization of the serum amyloid A3 enhancer factor. J. Biol. Chem . 274 : 24649—24656. PMID 10455131 DOI :10.1074/jbc.274.35.24649
Jane S.M., Nienhuis A.W., Cunningham J.M. (1995). Hemoglobin switching in man and chicken is mediated by a heteromeric complex between the ubiquitous transcription factor CP2 and a developmentally specific protein. EMBO J . 14 : 97—105. PMID 7828600
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші