NR2C1
Ідентифікатори
Символи
NR2C1 , TR2, Testicular receptor 2, nuclear receptor subfamily 2 group C member 1
Зовнішні ІД
OMIM : 601529 MGI: 1352465 HomoloGene: 55731 GeneCards: NR2C1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • signaling receptor activity
Клітинна компонента
• PML body • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 95.02 – 95.07 Mb
Хр. 10: 93.98 – 94.03 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NR2C1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 603 амінокислот , а молекулярна маса — 67 315[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MATIEEIAHQ IIEQQMGEIV TEQQTGQKIQ IVTALDHNTQ GKQFILTNHD
GSTPSKVILA RQDSTPGKVF LTTPDAAGVN QLFFTTPDLS AQHLQLLTDN
SPDQGPNKVF DLCVVCGDKA SGRHYGAVTC EGCKGFFKRS IRKNLVYSCR
GSKDCIINKH HRNRCQYCRL QRCIAFGMKQ DSVQCERKPI EVSREKSSNC
AASTEKIYIR KDLRSPLTAT PTFVTDSEST RSTGLLDSGM FMNIHPSGVK
TESAVLMTSD KAESCQGDLS TLANVVTSLA NLGKTKDLSQ NSNEMSMIES
LSNDDTSLCE FQEMQTNGDV SRAFDTLAKA LNPGESTACQ SSVAGMEGSV
HLITGDSSIN YTEKEGPLLS DSHVAFRLTM PSPMPEYLNV HYIGESASRL
LFLSMHWALS IPSFQALGQE NSISLVKAYW NELFTLGLAQ CWQVMNVATI
LATFVNCLHN SLQQDKMSTE RRKLLMEHIF KLQEFCNSMV KLCIDGYEYA
YLKAIVLFSP DHPSLENMEQ IEKFQEKAYV EFQDYITKTY PDDTYRLSRL
LLRLPALRLM NATITEELFF KGLIGNIRID SVIPHILKME PADYNSQIIG
HSI
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , рецепторів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Chang C., Kokontis J. (1988). Identification of a new member of the steroid receptor super-family by cloning and sequence analysis. Biochem. Biophys. Res. Commun . 155 : 971—977. PMID 3421977 DOI :10.1016/S0006-291X(88)80591-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Lin Y.L., Wang Y.H., Lee H.J. (2006). Transcriptional regulation of the human TR2 orphan receptor gene by nuclear factor 1-A. Biochem. Biophys. Res. Commun . 350 : 430—436. PMID 17010934 DOI :10.1016/j.bbrc.2006.09.061
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші