ELF4
ELF4
Ідентифікатори
Символи
ELF4 , ELFR, MEF, E74 like ETS transcription factor 4, AIFBL2
Зовнішні ІД
OMIM : 300775 MGI: 1928377 HomoloGene: 31036 GeneCards: ELF4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• PML body • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес
• natural killer cell proliferation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • NK T cell proliferation • диференціація клітин • вроджений імунітет • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. X: 130.06 – 130.11 Mb
Хр. X: 47.5 – 47.55 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ELF4 (англ. E74 like ETS transcription factor 4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот , а молекулярна маса — 70 730[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAITLQPSDL IFEFASNGMD DDIHQLEDPS VFPAVIVEQV PYPDLLHLYS
GLELDDVHNG IITDGTLCMT QDQILEGSFL LTDDNEATSH TMSTAEVLLN
MESPSDILDE KQIFSTSEML PDSDPAPAVT LPNYLFPASE PDALNRAGDT
SDQEGHSLEE KASREESAKK TGKSKKRIRK TKGNRSTSPV TDPSIPIRKK
SKDGKGSTIY LWEFLLALLQ DRNTCPKYIK WTQREKGIFK LVDSKAVSKL
WGKQKNKPDM NYETMGRALR YYYQRGILAK VEGQRLVYQF KEMPKDLVVI
EDEDESSEAT AAPPQASTAS VASASTTRRT SSRVSSRSAP QGKGSSSWEK
PKIQHVGLQP SASLELGPSL DEEIPTTSTM LVSPAEGQVK LTKAVSASSV
PSNIHLGVAP VGSGSALTLQ TIPLTTVLTN GPPASTTAPT QLVLQSVPAA
STFKDTFTLQ ASFPLNASFQ DSQVAAPGAP LILSGLPQLL AGANRPTNPA
PPTVTGAGPA GPSSQPPGTV IAAFIRTSGT TAAPRVKEGP LRSSSYVQGM
VTGAPMEGLL VPEETLRELL RDQAHLQPLP TQVVSRGSHN PSLLGNQTLS
PPSRPTVGLT PVAELELSSG SGSLLMAEPS VTTSGSLLTR SPTPAPFSPF
NPTSLIKMEP HDI
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Mao S., Frank R.C., Zhang J., Miyazaki Y., Nimer S.D. (1999). Functional and physical interactions between AML1 proteins and an ETS protein, MEF: implications for the pathogenesis of t(8;21)-positive leukemias . Mol. Cell. Biol . 19 : 3635—3644. PMID 10207087 DOI :10.1128/MCB.19.5.3635
Hedvat C.V., Yao J., Sokolic R.A., Nimer S.D. (2004). Myeloid ELF1-like factor is a potent activator of interleukin-8 expression in hematopoietic cells. J. Biol. Chem . 279 : 6395—6400. PMID 14625302 DOI :10.1074/jbc.M307524200
Miyazaki Y., Sun X., Uchida H., Zhang J., Nimer S. (1996). MEF, a novel transcription factor with an Elf-1 like DNA binding domain but distinct transcriptional activating properties. Oncogene . 13 : 1721—1729. PMID 8895518
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші