PROFILPELAJAR.COM

OTX1
Ідентифікатори
Символи	OTX1, orthodenticle homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600036 MGI: 97450 HomoloGene: 7875 GeneCards: OTX1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• diencephalon morphogenesis; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • multicellular organism development; • metencephalon development; • forebrain development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • inner ear morphogenesis; • midbrain development; • anterior/posterior pattern specification; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5013
	18423
	ENSG00000115507
	ENSMUSG00000005917
	P32242
	P80205
	NM_001199770; NM_014562
	NM_011023
	NP_001186699; NP_055377
	NP_035153
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OTX1 (англ. Orthodenticle homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 37 327^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMSYLKQPPY	GMNGLGLAGP	AMDLLHPSVG	YPATPRKQRR	ERTTFTRSQL
DVLEALFAKT	RYPDIFMREE	VALKINLPES	RVQVWFKNRR	AKCRQQQQSG
SGTKSRPAKK	KSSPVRESSG	SESSGQFTPP	AVSSSASSSS	SASSSSANPA
AAAAAGLGGN	PVAAASSLST	PAASSIWSPA	SISPGSAPAS	VSVPEPLAAP
SNTSCMQRSV	AAGAATAAAS	YPMSYGQGGS	YGQGYPTPSS	SYFGGVDCSS
YLAPMHSHHH	PHQLSPMAPS	SMAGHHHHHP	HAHHPLSQSS	GHHHHHHHHH
HQGYGGSGLA	FNSADCLDYK	EPGAAAASSA	WKLNFNSPDC	LDYKDQASWR
FQVL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Larsen K.B., Lutterodt M., Rath M.F., Moeller M. (2009). Expression of the homeobox genes PAX6, OTX2, and OTX1 in the early human fetal retina. Int. J. Dev. Neurosci. 27: 485—492. PMID 19414065 DOI:10.1016/j.ijdevneu.2009.04.004
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033