NFKB2
NFKB2
Ідентифікатори
Символи
NFKB2 , CVID10, H2TF1, LYT-10, LYT10, NF-kB2, p105, p52, p100, p49/p100, nuclear factor kappa B subunit 2
Зовнішні ІД
OMIM : 164012 MGI: 1099800 HomoloGene: 1873 GeneCards: NFKB2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • Bcl3/NF-kappaB2 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• response to cytokine • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • germinal center formation • GO:0010260 старіння людини • extracellular matrix organization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • spleen development • transcription, DNA-templated • follicular dendritic cell differentiation • response to lipopolysaccharide • NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • inflammatory response • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription by RNA polymerase II • вроджений імунітет
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 10: 102.39 – 102.4 Mb
Хр. 19: 46.29 – 46.3 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NFKB2 (англ. Nuclear factor kappa B subunit 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 900 амінокислот , а молекулярна маса — 96 749[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MESCYNPGLD GIIEYDDFKL NSSIVEPKEP APETADGPYL VIVEQPKQRG
FRFRYGCEGP SHGGLPGASS EKGRKTYPTV KICNYEGPAK IEVDLVTHSD
PPRAHAHSLV GKQCSELGIC AVSVGPKDMT AQFNNLGVLH VTKKNMMGTM
IQKLQRQRLR SRPQGLTEAE QRELEQEAKE LKKVMDLSIV RLRFSAFLRA
SDGSFSLPLK PVISQPIHDS KSPGASNLKI SRMDKTAGSV RGGDEVYLLC
DKVQKDDIEV RFYEDDENGW QAFGDFSPTD VHKQYAIVFR TPPYHKMKIE
RPVTVFLQLK RKRGGDVSDS KQFTYYPLVE DKEEVQRKRR KALPTFSQPF
GGGSHMGGGS GGAAGGYGGA GGGGSLGFFP SSLAYSPYQS GAGPMGCYPG
GGGGAQMAAT VPSRDSGEEA AEPSAPSRTP QCEPQAPEML QRAREYNARL
FGLAQRSARA LLDYGVTADA RALLAGQRHL LTAQDENGDT PLHLAIIHGQ
TSVIEQIVYV IHHAQDLGVV NLTNHLHQTP LHLAVITGQT SVVSFLLRVG
ADPALLDRHG DSAMHLALRA GAGAPELLRA LLQSGAPAVP QLLHMPDFEG
LYPVHLAVRA RSPECLDLLV DSGAEVEATE RQGGRTALHL ATEMEELGLV
THLVTKLRAN VNARTFAGNT PLHLAAGLGY PTLTRLLLKA GADIHAENEE
PLCPLPSPPT SDSDSDSEGP EKDTRSSFRG HTPLDLTCST KVKTLLLNAA
QNTMEPPLTP PSPAGPGLSL GDTALQNLEQ LLDGPEAQGS WAELAERLGL
RSLVDTYRQT TSPSGSLLRS YELAGGDLAG LLEALSDMGL EEGVRLLRGP
ETRDKLPSTA EVKEDSAYGS QSVEQEAEKL GPPPEPPGGL CHGHPQPQVH
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
Schmid R.M., Perkins N.D., Duckett C.S., Andrews P.C., Nabel G.J. (1991). Cloning of an NF-kappa B subunit which stimulates HIV transcription in synergy with p65. Nature . 352 : 733—736. PMID 1876189 DOI :10.1038/352733a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Liptay S., Schmid R.M., Nabel E.G., Nabel G.J. (1994). Transcriptional regulation of NF-kappa B2: evidence for kappa B-mediated positive and negative autoregulation . Mol. Cell. Biol . 14 : 7695—7703. PMID 7969113 DOI :10.1128/MCB.14.12.7695
Li Z., Nabel G.J. (1997). A new member of the IkappaB protein family, IkappaB epsilon, inhibits RelA (p65)-mediated NF-kappaB transcription . Mol. Cell. Biol . 17 : 6184—6190. PMID 9315679 DOI :10.1128/MCB.17.10.6184
Heusch M., Lin L., Geleziunas R., Greene W.C. (1999). The generation of nfkb2 p52: mechanism and efficiency. Oncogene . 18 : 6201—6208. PMID 10597218 DOI :10.1038/sj.onc.1203022
Betts J.C., Nabel G.J. (1996). Differential regulation of NF-kappaB2(p100) processing and control by amino-terminal sequences . Mol. Cell. Biol . 16 : 6363—6371. PMID 8887665 DOI :10.1128/MCB.16.11.6363
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші