FOXA2
FOXA2
Ідентифікатори
Символи
FOXA2 , HNF3B, TCF3B, forkhead box A2, HNF-3-beta
Зовнішні ІД
OMIM : 600288 MGI: 1347476 HomoloGene: 7762 GeneCards: FOXA2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • нуклеоплазма • міжклітинні контакти • клітинне ядро
Біологічний процес
• dopaminergic neuron differentiation • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of gastrulation • response to interleukin-6 • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cell fate specification • adult locomotory behavior • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • negative regulation of glucokinase activity • negative regulation of detection of glucose • regulation of blood coagulation • positive regulation of embryonic development • primitive streak formation • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • endocrine pancreas development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin • anatomical structure morphogenesis • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter by glucose • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 20: 22.58 – 22.59 Mb
Хр. 2: 147.88 – 147.89 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
FOXA2 (англ. Forkhead box A2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот , а молекулярна маса — 48 306[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLGAVKMEGH EPSDWSSYYA EPEGYSSVSN MNAGLGMNGM NTYMSMSAAA
MGSGSGNMSA GSMNMSSYVG AGMSPSLAGM SPGAGAMAGM GGSAGAAGVA
GMGPHLSPSL SPLGGQAAGA MGGLAPYANM NSMSPMYGQA GLSRARDPKT
YRRSYTHAKP PYSYISLITM AIQQSPNKML TLSEIYQWIM DLFPFYRQNQ
QRWQNSIRHS LSFNDCFLKV PRSPDKPGKG SFWTLHPDSG NMFENGCYLR
RQKRFKCEKQ LALKEAAGAA GSGKKAAAGA QASQAQLGEA AGPASETPAG
TESPHSSASP CQEHKRGGLG ELKGTPAAAL SPPEPAPSPG QQQQAAAHLL
GPPHHPGLPP EAHLKPEHHY AFNHPFSINN LMSSEQQHHH SHHHHQPHKM
DLKAYEQVMH YPGYGSPMPG SLAMGPVTNK TGLDASPLAA DTSYYQGVYS
RPIMNSS
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , регуляторів хроматину , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Wolfrum C., Besser D., Luca E., Stoffel M. (2003). Insulin regulates the activity of forkhead transcription factor Hnf-3beta/Foxa-2 by Akt-mediated phosphorylation and nuclear/cytosolic localization. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 100 : 11624—11629. PMID 14500912 DOI :10.1073/pnas.1931483100
Verschuur M., de Jong M., Felida L., de Maat M.P., Vos H.L. (2005). A hepatocyte nuclear factor-3 site in the fibrinogen beta promoter is important for interleukin 6-induced expression, and its activity is influenced by the adjacent -148C/T polymorphism. J. Biol. Chem . 280 : 16763—16771. PMID 15737987 DOI :10.1074/jbc.M501973200
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші