Bakonya nevét 1431-ben említette először oklevél egy idevaló lakosa nevében. 1808-ban Bakanya, Bachendorf, Bakája, 1888-ban Bekia, 1913-ban Bakonya néven írták.
A település birtokosai a Bakay család tagjai voltak. 1441-ben Bakay Zsigmond fia János, 1450-ben pedig Baka-i Zsigmond Ilona nevű leányát említették, aki Gyerővásárhelyi Gyerőfi Mihály felesége volt. 1518-ban v. Bakanya néven volt említve mint Al-Diód, algyógi uradalom része.