Ο Ιωαννίκιος Α΄ διετέλεσε Μητροπολίτης Σωζοπόλεως και το 1524 έγινε αντικανονικά^[1] Πατριάρχης Κωνσταντινουπόλεως υποσχόμενος στον Σουλτάνο να ανεβάσει τον ετήσιο φόρο που πλήρωνε το Πατριαρχείο σε 5.000 φλουριά^[2].

Η εκλογή του δεν έγινε δεκτή από τον λαό^[1] και η πατριαρχία του ήταν σύντομη, καθώς καθαιρέθηκε από δύο Συνόδους, μια στην Κωνσταντινούπολη και μια στα Ιεροσόλυμα. Έτσι, στις 25 Σεπτεμβρίου 1525 εκθρονίστηκε με βεράτι του Σουλτάνου Σουλεϊμάν Α΄^[3] και επανήλθε ο προκάτοχός του Ιερεμίας Α΄^[4]. Κατόπιν ο Ιωαννίκιος αποσύρθηκε στη Μονή του Τιμίου Προδρόμου κοντά στη Σωζόπολη, όπου μόνασε μέχρι το θάνατό του.

• Οικουμενικό Πατριαρχείο Αρχειοθετήθηκε 2010-06-16 στο Wayback Machine.
• Προκόπιος Τσιμάνης (1981). Από υψηλή σκοπιά οι Πατριάρχαι Κωνσταντινουπόλεως, τόμ. Α΄. σελ. 135. 
• Κοµνηνός Υψηλάντης, Αθανάσιος (1870). Εκκλησιαστικών και πολιτικών των εις δώδεκα, Βιβλίον Η, Θ΄και Ι΄ ήτοι Τα µετά την Άλωσιν (1453-1789), (Εκ χειρογράφου της ιεράς µονής του Σινά). Κωνσταντινούπολη: εκδιδόντος Αρχιµ. Γερµανού Αφθονίδου Σιναΐτου. 
• Ζαχαριάδου, Ελισάβετ Α. (1996). Δέκα τουρκικά έγγραφα για την Μεγάλη Εκκλησία (1483-1567) (PDF). Αθήνα: Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών, Ινστιτούτο Βυζαντινών Ερευνών. ISBN 960-7094-69-7. 
• Παΐζη-Αποστολοπούλου, Μάχη (1995). Ο Θεσμός της πατριαρχικής εξαρχίας: 14ος-19ος αιώνας (PDF). Αθήνα: Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών. ISBN 960-7094-32-8.