PROFILPELAJAR.COM

ALCAM
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5A2F
Ідентифікатори
Символи	ALCAM, CD166, MEMD, activated leukocyte cell adhesion molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 601662 MGI: 1313266 HomoloGene: 1229 GeneCards: ALCAM
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • signaling receptor binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell projection; • мембрана; • focal adhesion; • intrinsic component of plasma membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • T cell receptor complex; • extracellular region; • аксон; • soma; • дендрит (нейробіологія); • immunological synapse; • екзосома; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • адаптивна імунна відповідь; • процес імунної системи; • neuron projection extension; • адгезія клітин; • motor neuron axon guidance; • axon extension involved in axon guidance; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • retinal ganglion cell axon guidance; • axon guidance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	214
	11658
	ENSG00000170017
	ENSMUSG00000022636
	Q13740
	Q61490
	NM_001627; NM_001243280; NM_001243281; NM_001243283
	NM_009655; NM_001331110
	NP_001230209; NP_001230210; NP_001230212; NP_001618
	NP_001318039; NP_033785
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ALCAM (англ. Activated leukocyte cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 65 102^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESKGASSCR	LLFCLLISAT	VFRPGLGWYT	VNSAYGDTII	IPCRLDVPQN
LMFGKWKYEK	PDGSPVFIAF	RSSTKKSVQY	DDVPEYKDRL	NLSENYTLSI
SNARISDEKR	FVCMLVTEDN	VFEAPTIVKV	FKQPSKPEIV	SKALFLETEQ
LKKLGDCISE	DSYPDGNITW	YRNGKVLHPL	EGAVVIIFKK	EMDPVTQLYT
MTSTLEYKTT	KADIQMPFTC	SVTYYGPSGQ	KTIHSEQAVF	DIYYPTEQVT
IQVLPPKNAI	KEGDNITLKC	LGNGNPPPEE	FLFYLPGQPE	GIRSSNTYTL
TDVRRNATGD	YKCSLIDKKS	MIASTAITVH	YLDLSLNPSG	EVTRQIGDAL
PVSCTISASR	NATVVWMKDN	IRLRSSPSFS	SLHYQDAGNY	VCETALQEVE
GLKKRESLTL	IVEGKPQIKM	TKKTDPSGLS	KTIICHVEGF	PKPAIQWTIT
GSGSVINQTE	ESPYINGRYY	SKIIISPEEN	VTLTCTAENQ	LERTVNSLNV
SAISIPEHDE	ADEISDENRE	KVNDQAKLIV	GIVVGLLLAA	LVAGVVYWLY
MKKSKTASKH	VNKDLGNMEE	NKKLEENNHK	TEA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

Ikeda K., Quertermous T. (2004). Molecular isolation and characterization of a soluble isoform of activated leukocyte cell adhesion molecule that modulates endothelial cell function. J. Biol. Chem. 279: 55315—55323. PMID 15496415 doi:10.1074/jbc.M407776200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Skonier J.E., Bowen M.A., Emswiler J., Aruffo A., Bajorath J. (1996). Recognition of diverse proteins by members of the immunoglobulin superfamily: delineation of the receptor binding site in the human CD6 ligand ALCAM. Biochemistry. 35: 12287—12291. PMID 8823162 doi:10.1021/bi961038k
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 doi:10.1038/nbt827
Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 doi:10.1002/eji.200424856
Bajorath J., Bowen M.A., Aruffo A. (1995). Molecular model of the N-terminal receptor-binding domain of the human CD6 ligand ALCAM. Protein Sci. 4: 1644—1647. PMID 8520490 doi:10.1002/pro.5560040822

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:400 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13740 (англ.) . Архів оригіналу за 27 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:400 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q13740 (англ.) . Архів оригіналу за 27 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]