PDGFRB

PDGFRB
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PDGFRB, CD140B, IBGC4, IMF1, JTK12, PDGFR, PDGFR-1, PDGFR1, KOGS, PENTT, platelet derived growth factor receptor beta
Зовнішні ІД OMIM: 173410 MGI: 97531 HomoloGene: 1960 GeneCards: PDGFRB
Пов'язані генетичні захворювання
гострий мієлоїдний лейкоз, juvenile myelomonocytic leukemia, infantile myofibromatosis, Kosaki overgrowth syndrome, acroosteolysis-keloid-like lesions-premature aging syndrome[1]
Реагує на сполуку
cediranib, crenolanib, linifanib, Масітиніб, Нінтеданіб, Пазопаніб, semaxanib, сунітиніб, vatalanib, Нінтеданіб, іматиніб, Масітиніб, Бекаплермін, famitinib, orantinib, PD166285, MLN-518, imatinib mesylate[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_002609
NM_001355016
NM_001355017
NM_001146268
NM_008809
RefSeq (білок)
NP_002600
NP_001341945
NP_001341946
NP_001139740
NP_032835
Локус (UCSC) Хр. 5: 150.11 – 150.16 Mb Хр. 18: 61.18 – 61.22 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PDGFRB (англ. Platelet derived growth factor receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 106 амінокислот, а молекулярна маса — 123 968[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLLEPQISQGLVVTPPGPELVLNVSSTF
VLTCSGSAPVVWERMSQEPPQEMAKAQDGTFSSVLTLTNLTGLDTGEYFC
THNDSRGLETDERKRLYIFVPDPTVGFLPNDAEELFIFLTEITEITIPCR
VTDPQLVVTLHEKKGDVALPVPYDHQRGFSGIFEDRSYICKTTIGDREVD
SDAYYVYRLQVSSINVSVNAVQTVVRQGENITLMCIVIGNEVVNFEWTYP
RKESGRLVEPVTDFLLDMPYHIRSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDH
QDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHRSRTLQVVFEAYPPPTVLW
FKDNRTLGDSSAGEIALSTRNVSETRYVSELTLVRVKVAEAGHYTMRAFH
EDAEVQLSFQLQINVPVRVLELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSA
CRDLKRCPRELPPTLLGNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHV
DRPLSVRCTLRNAVGQDTQEVIVVPHSLPFKVVVISAILALVVLTIISLI
ILIMLWQKKPRYEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQL
VLGRTLGSGAFGQVVEATAHGLSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMS
ELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIITEYCRYGDLVDYLHRNKHTF
LQHHSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYMDMSKDESVD
YVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPVLSY
MDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARD
IMRDSNYISKGSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLG
GTPYPELPMNEQFYNAIKRGYRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPP
FSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRSDHPAILRSQARLPGFHGLRS
PLDTSSVLYTAVQPNEGDNDYIIPLPDPKPEVADEGPLEGSPSLASSTLN
EVNTSSTISCDSPLEPQDEPEPEPQLELQVEPEPELEQLPDSGCPAPRAE
AEDSFL

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як хемотаксис, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Roberts W.M., Look A.T., Roussel M.F., Sherr C.J. (1988). Tandem linkage of human CSF-1 receptor (c-fms) and PDGF receptor genes. Cell. 55: 655—661. PMID 2846185 DOI:10.1016/0092-8674(88)90224-3
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
  • Kazlauskas A., Cooper J.A. (1989). Autophosphorylation of the PDGF receptor in the kinase insert region regulates interactions with cell proteins. Cell. 58: 1121—1133. PMID 2550144 DOI:10.1016/0092-8674(89)90510-2
  • Sorkin A., Westermark B., Heldin C.H., Claesson-Welsh L. (1991). Effect of receptor kinase inactivation on the rate of internalization and degradation of PDGF and the PDGF beta-receptor. J. Cell Biol. 112: 469—478. PMID 1846866 DOI:10.1083/jcb.112.3.469
  • Kazlauskas A., Kashishian A., Cooper J.A., Valius M. (1992). GTPase-activating protein and phosphatidylinositol 3-kinase bind to distinct regions of the platelet-derived growth factor receptor beta subunit. Mol. Cell. Biol. 12: 2534—2544. PMID 1375321 DOI:10.1128/MCB.12.6.2534

Примітки

Див. також