PROFILPELAJAR.COM

CLEC4M
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH
Ідентифікатори
Символи	CLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M
Зовнішні ІД	OMIM: 605872 MGI: 2157942 HomoloGene: 129771 GeneCards: CLEC4M
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • virus receptor activity; • зв'язування з іоном металу; • calcium-dependent protein binding; • mannose binding; • virion binding; • ICAM-3 receptor activity; • carbohydrate binding; • signaling receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • host cell;
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion; • cell-cell recognition; • GO:0046795 intracellular transport of virus; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • antigen processing and presentation; • ендоцитоз; • адаптивна імунна відповідь; • процес імунної системи; • viral genome replication; • peptide antigen transport; • modulation by virus of host process; • вроджений імунітет; • GO:0022415 viral process; • virion attachment to host cell; • viral entry into host cell;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10332
	170786
	ENSG00000104938
	ENSMUSG00000031494
	Q9H2X3
	Q91ZX1
NM_001144904; NM_001144905; NM_001144906; NM_001144907; NM_001144908;
	NM_001144909; NM_001144910; NM_001144911; NM_014257; NM_214675; NM_214676
	NM_133238
NP_001138376; NP_001138377; NP_001138378; NP_001138379; NP_001138380;
	NP_001138381; NP_001138382; NP_001138383; NP_055072
	NP_573501
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 45 350^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDSKEPRVQ	QLGLLEEDPT	TSGIRLFPRD	FQFQQIHGHK	SSTGCLGHGA
LVLQLLSFML	LAGVLVAILV	QVSKVPSSLS	QEQSEQDAIY	QNLTQLKAAV
GELSEKSKLQ	EIYQELTQLK	AAVGELPEKS	KLQEIYQELT	RLKAAVGELP
EKSKLQEIYQ	ELTRLKAAVG	ELPEKSKLQE	IYQELTRLKA	AVGELPEKSK
LQEIYQELTE	LKAAVGELPE	KSKLQEIYQE	LTQLKAAVGE	LPDQSKQQQI
YQELTDLKTA	FERLCRHCPK	DWTFFQGNCY	FMSNSQRNWH	DSVTACQEVR
AQLVVIKTAE	EQNFLQLQTS	RSNRFSWMGL	SDLNQEGTWQ	WVDGSPLSPS
FQRYWNSGEP	NNSGNEDCAE	FSGSGWNDNR	CDVDNYWICK	KPAACFRDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Yokoyama-Kobayashi M., Yamaguchi T., Sekine S., Kato S. (1999). Selection of cDNAs encoding putative type II membrane proteins on the cell surface from a human full-length cDNA bank. Gene. 228: 161—167. PMID 10072769 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00004-9
Soilleux E.J., Barten R., Trowsdale J. (2000). DC-SIGN, a related gene, DC-SIGNR, and CD23 form a cluster on 19p13. J. Immunol. 165: 2937—2942. PMID 10975799 DOI:10.4049/jimmunol.165.6.2937
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mitchell D.A., Fadden A.J., Drickamer K. (2001). A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands. J. Biol. Chem. 276: 28939—28945. PMID 11384997 DOI:10.1074/jbc.M104565200
Jeffers S.A., Hemmila E.M., Holmes K.V. (2006). Human coronavirus 229E can use CD209L (L-SIGN) to enter cells. Adv. Exp. Med. Biol. 581: 265—269. PMID 17037540 DOI:10.1007/978-0-387-33012-9_44
da Silva R.C., Segat L., Crovella S. (2011). Role of DC-SIGN and L-SIGN receptors in HIV-1 vertical transmission. Hum. Immunol. 72: 305—311. PMID 21277928 DOI:10.1016/j.humimm.2011.01.012

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13523 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9H2X3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13523 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9H2X3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]