PROFILPELAJAR.COM

SEMA4D
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1OLZ, 3OL2
Ідентифікатори
Символи	SEMA4D, C9orf164, CD100, M-sema-G, SEMAJ, coll-4, semaphorin 4D, COLL4, A8, GR3, BB18
Зовнішні ІД	OMIM: 601866 MGI: 109244 HomoloGene: 21282 GeneCards: SEMA4D
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding; • transmembrane signaling receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • semaphorin receptor binding; • neuropilin binding; • identical protein binding; • signaling receptor activity; • chemorepellent activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• regulation of dendrite morphogenesis; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • multicellular organism development; • leukocyte aggregation; • нейробіологія розвитку; • negative regulation of cell adhesion; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • positive regulation of axonogenesis; • semaphorin-plexin signaling pathway involved in bone trabecula morphogenesis; • regulation of cell projection organization; • negative regulation of osteoblast differentiation; • positive regulation of collateral sprouting; • regulation of cell shape; • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • диференціація клітин; • positive regulation of protein phosphorylation; • semaphorin-plexin signaling pathway; • адгезія клітин; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • ossification involved in bone maturation; • positive regulation of cell migration; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • negative regulation of alkaline phosphatase activity; • negative chemotaxis; • neural crest cell migration; • negative regulation of axon extension involved in axon guidance; • positive regulation of inhibitory synapse assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10507
	20354
	ENSG00000187764
	ENSMUSG00000021451
	Q92854
	O09126
NM_001142287; NM_006378; NM_182635; NM_001371194; NM_001371195;
	NM_001371196; NM_001371197; NM_001371198; NM_001371199; NM_001371200; NM_001371201; NM_001371202
	NM_001281880; NM_013660
NP_001135759; NP_006369; NP_001358123; NP_001358124; NP_001358125;
	NP_001358126; NP_001358127; NP_001358128; NP_001358129; NP_001358130; NP_001358131
NP_001268809; NP_038688; NP_001365242; NP_001365243; NP_001365246;
	NP_001365247; NP_001365248; NP_001365249; NP_001365251; NP_001365252; NP_001365253; NP_001365244; NP_001365245; NP_001365250; NP_001365254
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SEMA4D (англ. Semaphorin 4D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 96 150^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRMCTPIRGL	LMALAVMFGT	AMAFAPIPRI	TWEHREVHLV	QFHEPDIYNY
SALLLSEDKD	TLYIGAREAV	FAVNALNISE	KQHEVYWKVS	EDKKAKCAEK
GKSKQTECLN	YIRVLQPLSA	TSLYVCGTNA	FQPACDHLNL	TSFKFLGKNE
DGKGRCPFDP	AHSYTSVMVD	GELYSGTSYN	FLGSEPIISR	NSSHSPLRTE
YAIPWLNEPS	FVFADVIRKS	PDSPDGEDDR	VYFFFTEVSV	EYEFVFRVLI
PRIARVCKGD	QGGLRTLQKK	WTSFLKARLI	CSRPDSGLVF	NVLRDVFVLR
SPGLKVPVFY	ALFTPQLNNV	GLSAVCAYNL	STAEEVFSHG	KYMQSTTVEQ
SHTKWVRYNG	PVPKPRPGAC	IDSEARAANY	TSSLNLPDKT	LQFVKDHPLM
DDSVTPIDNR	PRLIKKDVNY	TQIVVDRTQA	LDGTVYDVMF	VSTDRGALHK
AISLEHAVHI	IEETQLFQDF	EPVQTLLLSS	KKGNRFVYAG	SNSGVVQAPL
AFCGKHGTCE	DCVLARDPYC	AWSPPTATCV	ALHQTESPSR	GLIQEMSGDA
SVCPDKSKGS	YRQHFFKHGG	TAELKCSQKS	NLARVFWKFQ	NGVLKAESPK
YGLMGRKNLL	IFNLSEGDSG	VYQCLSEERV	KNKTVFQVVA	KHVLEVKVVP
KPVVAPTLSV	VQTEGSRIAT	KVLVASTQGS	SPPTPAVQAT	SSGAITLPPK
PAPTGTSCEP	KIVINTVPQL	HSEKTMYLKS	SDNRLLMSLF	LFFFVLFLCL
FFYNCYKGYL	PRQCLKFRSA	LLIGKKKPKS	DFCDREQSLK	ETLVEPGSFS
QQNGEHPKPA	LDTGYETEQD	TITSKVPTDR	EDSQRIDDLS	ARDKPFDVKC
ELKFADSDAD	GD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Basile J.R., Afkhami T., Gutkind J.S. (2005). Semaphorin 4D/plexin-B1 induces endothelial cell migration through the activation of PYK2, Src, and the phosphatidylinositol 3-kinase-Akt pathway. Mol. Cell. Biol. 25: 6889—6898. PMID 16055703 doi:10.1128/MCB.25.16.6889-6898.2005
Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 doi:10.1074/mcp.M500324-MCP200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10732 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92854 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.