Nella stagione 2006-2007 l'Udinese disputa il massimo campionato, con 46 punti ottiene il decimo posto. Confermato il tecnico Giovanni Galeone, dopo il discreto finale della scorsa stagione, ma la partenza non è delle migliori, nell'ultima del girone di andata i friulani perdono (2-0) a Palermo, il patron Pozzo dà il benservito a Giovanni Galeone, con l'Udinese a 23 punti a metà classifica in nona posizione, al suo posto viene chiamato Alberto Malesani, che con un netto cambio tattico riesce da subito a raccogliere buoni frutti, ma è un fuoco di paglia, perché il finale di torneo è ancora amaro, con l'Udinese che non riesce a tenere il passo con le sue ambizioni, chiudendo con tre sconfitte nelle ultime quattro partite, si deve accontentare del decimo posto, perdendo così la qualificazione alla Coppa UEFA. Nella Coppa Italia i bianconeri superano il Melfi nel primo turno, l'Albinoleffe nel secondo, poi nel terzo turno escono dal torneo, perdendo ad Arezzo (6-5) dopo i calci di rigore.
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