Nella stagione 2006-2007 l'AlbinoLeffe disputa il campionato di Serie B, con 53 punti ottiene il decimo posto. Allenata ancora da Emiliano Mondonico raccoglie 29 punti nel girone di andata, e 24 nel girone di ritorno. Il miglior marcatore stagionale dei seriani è stato Francesco Ruopolo arrivato a gennaio dalla Triestina, realizzando il suo bottino nel solo girone di ritorno. Nella Coppa Italia l'Albinoleffe supera nel primo turno l'Avellino, mentre nel secondo turno esce dal torneo superato dall'Udinese, in entrambi i turni si sono disputati i tempi supplementari.
^abCeduto durante la sessione estiva del calciomercato, a stagione in corso.
^abCeduto durante la sessione invernale del calciomercato.
^Acquistato durante la sessione invernale del calciomercato.
^Acquistato durante la sessione estiva del calciomercato, a stagione in corso.
^Giornata rinviata al 17 aprile 2007, in segno di lutto per la morte dell'Ispettore di Polizia Filippo Raciti, nell'anticipo di Serie A Catania-Palermo del 2 febbraio, nei disordini del dopo-partita.
^Giornata rinviata al 1º maggio per l'impegno nelle nazionali di molti tesserati di Serie B.
^Partita disputata sul campo di Giugliano in Campania.
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