Entré à Saint-Cyr en 1913, il prépare l'École de guerre entre 1922 et 1924. Il effectue des recherches géologiques notamment en Autriche pour récolter des fossiles du Trias alpin. Nommé à l'état-major de Metz, il devient spécialiste des oursins fossiles.
Sa carrière militaire se termine en 1950 avec le grade de général de division, après les guerres de 1914-1918 au cours de laquelle il est blessé et de 1939-1945 où il est nommé chef d'état-major d'une division de chasseurs. À partir de 1950, il occupe le poste de paléontologue au Service géologique d'outre-mer, avant de devenir géologue en chef hors classe de la France d'outre-mer et paléontologue du Service géologique de Madagascar. En 1952, il dirige l'exploration géologique et paléontologique du sud de Madagascar, puis celle de l'ouest l'année suivante, jusqu'à Diego-Suarez.
Distinctions
Croix de guerre 1914-1918
Croix de guerre 1939-1945
Croix de guerre luxembourgeoise
Commandeur de la Légion d'honneur
Officier du mérite national malgache
Prix
1933 : Prix Roux de l'Académie des sciences
1955 : Prix Fontannes de la Société géologique de France
1959 : élu membre correspondant de l'Académie des sciences d'outre-mer ()
1959 : élu membre correspondant de l'Académie des Sciences
Principales publications
Collignon, M. (1948-1956) - Ammonites néocrétacées du Menabe (Madagascar) (en 6 volumes), Annales Géologiques du Service des Mines, Paris.
Collignon, M. (1958-1971) - Atlas des fossiles caractéristiques de Madagascar (en 17 volumes), Service Géologique de Madagascar, Tananarive.