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L'ambassade a été ouverte en 1978 par Gérard Dayries (initialement consul de France), chargé d'affaires nommé par Louis de Guiringaud, ministre des affaires étrangères de l'époque . Une fois les problèmes matériels résolus et les contacts politiques pris, Claude Copin devint le premier ambassadeur de France aux Comores et Gérard Dayries prit la direction du consulat.
Depuis la loi du [6] réformant la représentation des Français établis hors de France avec la mise en place de conseils consulaires au sein des missions diplomatiques, les ressortissants français des Comores élisent pour six ans un conseiller consulaire. Ce dernier a trois rôles :
il est un élu de proximité pour les Français de l'étranger ;
Pour l'élection à l'Assemblée des Français de l'étranger, les Comores appartenaient jusqu'en 2014 à la circonscription électorale de Tananarive[7], comprenant aussi Madagascar, Maurice et les Seychelles, et désignant quatre sièges. Les Comores appartiennent désormais à la circonscription électorale « Afrique centrale, australe et orientale » dont le chef-lieu est Libreville et qui désigne cinq de ses 37 conseillers consulaires pour siéger parmi les 90 membres de l'Assemblée des Français de l'étranger[8].
