L'ambassade est située sur l'un des principaux axes de la ville de Jakarta, l'avenue Thamrin dans la municipalité de Jakarta Pusat ou Jakarta Centre. La plupart des ambassades importantes s'étaient implantées dans ce quartier à l'indépendance de l'Indonésie et durant les années 1950 et 1960. Depuis, beaucoup ont déménagé plus vers le sud. Seules les ambassades de France, du Japon, d'Allemagne et du Royaume-Uni sont restées le long de l'axe le plus prestigieux de Jakarta.
En 2012, pour des raisons de sécurité et de besoin d'espace, une nouvelle ambassade est construite sur le site de l'ancienne et les services déménagent pour la durée des travaux dans une tour voisine[1]. La nouvelle ambassade ouvre en [2]. Elle est constituée de deux bâtiments, l'un abritant les services consulaires, dont l'accès, au nord, est restreint aux ressortissants européens et aux personnes souhaitant effectuer des démarches administratives; l'autre, donnant directement sur l'avenue Thamrin, accueillant l'Institut français d'Indonésie, un bar/restaurant, un auditorium et un grand patio pour les fréquents événements.
Le Timor oriental est une colonie portugaise à compter de l'année 1596. Le , profitant de la révolution des Œillets, le Fretilin déclare l'indépendance du Timor oriental. Mais le , l'Indonésieenvahit le territoire, dont elle fait sa 27e province. À la suite de la sécession en 1999 qui a occasionné la mise sous administration des Nations unies, le pays devient indépendant le . Le , l'ambassadeur de France en Indonésie est accrédité au Timor oriental.
Depuis le , les autorités indonésiennes n'autorisent plus la nomination de ressortissants étrangers en tant que consuls honoraires[12]. Les mandats ont été prolongés jusqu'en 2012 puis ont pris l'appellation de « relais de l'ambassade auprès de la communauté », à l'exception de l'agence consulaire honoraire de Bali qui a été confirmée par le gouvernement indonésien[13].
La représentation française au Timor oriental est située au bureau français de coopération, à Dili, capitale du pays.
Communauté française
Au , 4 395 Français sont inscrits sur le registre consulaire de Jakarta[14], ce nombre étant désormais en progression régulière après une baisse constatée depuis la crise de 1997[15].
Plus de 2 200 Français sont installés à Bali et 238 500 touristes français ont visité l'île en 2011[16].
Depuis la loi du [17] réformant la représentation des Français établis hors de France avec la mise en place de conseils consulaires au sein des missions diplomatiques, les ressortissants français de l'Indonésie élisent pour six ans trois conseillers consulaires. Ces derniers ont trois rôles :
ils sont des élus de proximité pour les Français de l'étranger ;
↑Nommé, en remplacement de Philippe Zeller, par décret le 10 février 2012[3], Bertrand Lortholary, ancien conseiller diplomatique de Nicolas Sarkozy, a été rappelé à la suite de l'annulation de sa nomination par le Conseil d'État[4], le 23 juillet 2012[5]. Il avait remis ses lettres de créance au président de la République indonésienne, Susilo Bambang Yudhoyono, le 9 mars 2012[6]. Stéphane Baumgarth est, dans l'intervalle, Chargé d'affaires a.i.