Вперше 5-та армія Вермахту була розгорнута осінню 1938 під час Судетської кризи й була розгорнута на західному кордоні Німеччини в районі Саар—Пфальц. Вона була створена на основі штабу і військ 6-го армійського корпусу на чолі з генералом від інфантеріїКуртом Лібманном. У складі армії входило п'ять дивізій, підлеглих командуванню 6-го армійського корпусу, і два прикордонні командування. Після закінчення кризи армія розформована.
13 жовтня 1939 року армія була перекинута до Польщі, де здійснювала функції окупаційних військ і була перейменована на командування частин прикордонної ділянки «Центр» (нім.Grenzschutz-abschnitts-kommando Mitte).
Georg Tessin: Verbände und Truppen der Deutschen Wehrmacht und Waffen-SS im Zweiten Weltkrieg 1939—1945. Band 2. Die Landstreitkräfte 1-5. 2. Auflage. Biblio-Verlag, Bissendorf 1973, ISBN 3-7648-0871-3.
* Частини Ваффенн-СС формально не були складовою Вермахту, але перебуваючи на фронті, знаходилися у підпорядкуванні (в оперативному відношенні) командування Вермахту