У лето1929. године, свратио је у Куманово да би предао неке задатке тамошњој партијској организацији, али су ту он и његов професор Милан Мијалковић били ухапшени августа 1929. године. Осуђен је на четири године робије, коју је издржао у Сремској Митровици и Лепоглави.
После издржане робије, настанио се у Београду (где су му се родитељи преселили) и прикључио се раду београдске партијске организације. На Покрајинској партијској конференцији, септембра1934. године, изабран је за секретара ПК КПЈ за Србију. Организовао је интензиван партијски рад, те низ илегалних и легалних састанака и штрајкова.
Организација је била проваљена у новембру1935. године, и Трајко је био ухапшен, заједно са већом групом руководећих људи. Био је осуђен на шест година робије. Казну је издржавао у Сремској Митровици, Марибору, Нишу, па поново у Митровици. Учествовао је у једанаестодневном штрајку глађу, октобра1936. године, у Сремској Митровици. Затвореници су штрајком успели да поправе свој положај. За време штрајка, Трајко је био теже оболео, али је оздравио.
Кад је избио рат, Немци су осуђене комунисте предали усташама. Знајући да неће дуго остати живи, група од око тридесет затвореника је успешно организовала бекство, копајући подземне канале. Трајко је такође побегао, тако да се до почетка септембра нашао на Фрушкој гори. После месец дана, пребацио се у Мачву. Тамо је прво био у Ваљевском, па у Ужичком одреду.
Истакути чланови Комунистичке партије Југославије и комунистички револуционари са територије југоисточне Србије, умрли или убијени у међуратном периоду или погинули у току рата
Лидери Комунистичке партије и Савеза комуниста Србије
Списак личности који су се налазили на челу партијске организације КПЈ у Србији као — секретари Покрајинског комитета КПЈ за Србију, секретари ЦК Комунистичке партије Србије и секретари/председници ЦК Савеза комуниста Србије