Játékfutása során Favre összesen 24 mérkőzést játszott a svájci válogatottban, egyetlen gólját egy Hollandia elleni mérkőzésen szerezte címeres mezben.[1]
Játékosként svájci és francia csapatokban szerepelt, pályára lépett a Lausanne, a Neuchâtel Xamax, a Servette és a Toulouse csapatában is. Pierre-Albert Chapuisat 1985-ben súlyos térdsérülést okozott neki, ami miatt nyolc hónapot kellett kihagynia. 1991-ben fejezte be pályafutását.[2]
Edzőként
Favre edzői karrierje 1991-ben kezdődött az Echallens csapatánál. Előbb az U14-es, majd az U17-es korosztályt irányította, végül az első csapat élére nevezték ki. Vezetésével a jórészt fiatalokra építő klub feljutott a másodosztályba, ami azóta is a klub legjobb eredménye.[3]
Neuchâtel Xamax
1995-ben a Neuchâtel Xamax akadémiájának szakmai igazgatója lett, ezt a posztot két éven át töltötte be.
Yverdon-Sport és Servette
1997 januárjában Favrét nevezték ki az Yverdon-Sport vezetőedzőjének. 1999-ben az élvonalba vezette a csapatot. A következő szezonban meglepetésre a bajnokság ötödik helyén zártak, ami az Yverdon legjobb bajnoki helyezése az élvonalban.
2000 nyarán a Servette irányítását vette át. 2001-ben csapatával megnyerte a Svájci Kupát, majd a következő idényben az UEFA-kupában szerepelt a Servette-tel.
Zürich
2003-ban a Zürich vezetőedzője lett, akikkel kupát, majd bajnoki címet nyert. 2007-ben egymást követő második alkalommal lett a Svájc Super Liga legjobb edzője.
Hertha BSC
2007. június 1-jén a német Bundesligában szereplő Hertha BSC vezetőedzője lett.[4] A 2008-09-es évadban a Dárdai Pált is soraiban tudó Hertha a negyedik helyen zárta a bajnokságot. A 2009-10-es szezon a pénzügyi nehézségek miatt már nem volt ennyire sikeres, távozott Josip Šimunić, Andrij Voronyin és Marko Pantelić is. 2009 szeptemberének végén a kiesés ellen harcoló Hertha vezetősége menesztette Favrét.[5]
Borussia Mönchengladbach
OGC Nice
2016. május 4-én a francia OGC Nice élére nevezték ki, Claude Puel utódjául. Annak ellenére, hogy állítólag az Everton is szerződtette volna a csapat élére, Favre a Nice-t választotta, mondván "belefáradt a várakozásba".[6][7] Első szezonja végén a nizzai csapat a bajnokság harmadik helyén végzett és kvalifikálta magát a Bajnokok Ligájába.[8]
Borussia Dortmund
2018. május 22-én a Borussia Dortmund vezetőedzője lett. A 2018-2019-es szezonban jól teljesített csapatával és úgy lehet tudni hogy májusban 2024-ig hosszabbítottak Favre-val.[9] Több mint két évet töltött el aklub vezetőedzőjeként, ezalatt azonban csupán egy német Szuperkupa-győzelmet ért el a csapattal, amely egyik szezonjában sem tudta felvenni a versenyt a Bayern Münchennnel. 2020 decemberében, a VfB Stuttgart elleni hazai pályán elszenvedett 5–1-es-es vereséget követően menesztették posztjáról.[10]
Ismét OGC Nice
2022. június 27-én visszatért vezetőedzőként a Nice csapatához.[11] Augusztus 7-én a Toulouse ellen 1–1-re végződő mérkőzésen mutatkozott be ismét.[12] 2023 januárjában menesztették, miután a kupában a harmadosztályú Le Puy Foot 43 Auvergne ellen 1–-ra alulmaradtak.[13]
