Στο πρωτάθλημα της Α΄ κατηγορίας 2005-06 συμμετείχαν 14 ομάδες. Όλες οι ομάδες αναμετρήθηκαν αναμεταξύ τους από δύο φορές, μία εντός και μία εκτός έδρας. Πρωταθλήτρια ανακηρύχτηκε η ομάδα που συγκέντρωσε τους περισσότερους βαθμούς. Οι τρεις τελευταίες ομάδες υποβιβάστηκαν στο πρωτάθλημα Β΄ κατηγορίας 2006-07.[4]
Επιπρόσθετα, μία από τις ομάδες του πρωταθλήματος εξασφάλιζε το δικαίωμα συμμετοχής στο Κύπελλο Ιντερτότο ΟΥΕΦΑ 2006. Όσες ομάδες επιθυμούσαν δήλωναν το ενδιαφέρον τους, πριν την ολοκλήρωση του πρωταθλήματος, για συμμετοχή στη διοργάνωση. Όποια από τις ομάδες αυτές τερμάτιζε ψηλότερα στο βαθμολογικό πίνακα συμμετείχε στο Ιντερτότο (εφόσον δεν είχε εξασφαλίσει τη συμμετοχή της σε άλλη διοργάνωση της ΟΥΕΦΑ).
Σύστημα βαθμολόγησης
Η νίκη βαθμολογείτο με 3 βαθμούς και η ισοπαλία με 1 βαθμό ενώ η ήττα δεν έδινε κανένα βαθμό.[4]
Τοποθεσίες ομάδων της Α΄ κατηγορίας 2005-06. Οι ομάδες που αναγράφονται με πλάγια γραφή χρησιμοποίησαν ποδοσφαιρικό στάδιο σε διαφορετική περιοχή γιατί τα στάδια της περιοχής τους δεν πληρούσαν τα κριτήρια για διεξαγωγή αγώνων Α΄ κατηγορίας.
Σημειώσεις: 1Λόγω ακαταλληλότητας της δικής της έδρας (Κοινοτικό Στάδιο Κυπερούντας) για διεξαγωγή αγώνων Α΄ κατηγορίας, η ΑΠΕΠ χρησιμοποίησε ως έδρα το Στάδιο ΘΟΪ Λακατάμιας. 2Λόγω ακαταλληλότητας της δικής του έδρας (Δημοτικό Στάδιο Πέγειας) για διεξαγωγή αγώνων Α΄ κατηγορίας, ο ΑΠΟΠ χρησιμοποίησε ως έδρα το Παφιακό Στάδιο.
Βαθμολογία
Η τελική βαθμολογία του πρωταθλήματος ήταν:[4][5][6][7]
1Για εκπροσώπηση της Κύπρου στο Ιντερτότο 2006 οι ομάδες δικαιούνταν να δηλώσουν το ενδιαφέρον τους κατά τη διάρκεια του πρωταθλήματος.[8] Δήλωσαν συμμετοχή μόνο οι Εθνικός Άχνας και Ολυμπιακός Λευκωσίας. Τη μία θέση που δικαιούταν η Κύπρος κατέλαβε η ομάδα, εξ αυτών που δήλωναν συμμετοχή, η οποία τερμάτισε ψηλότερα στην τελική βαθμολογία.[9]
Αποτελέσματα
Ο πίνακας που ακολουθεί παρουσιάζει τα αποτελέσματα των αγώνων του πρωταθλήματος:[4][5][6]
Από το 1941 έως το 1944 δε διεξήχθη πρωτάθλημα εξαιτίας του Β΄ Παγκοσμίου Πολέμου. Την περίοδο 1958-59 το πρωτάθλημα δεν διεξήχθη λόγω της έκρυθμης κατάστασης στην Κύπρο ως αποτέλεσμα του αγώνα της ΕΟΚΑ. Την περίοδο 1963-64 το πρωτάθλημα διακόπηκε λόγω των δικοινοτικών διαταραχών. Την περίοδο 2019-20 το πρωτάθλημα διακόπηκε λόγω της Πανδημίας του κορονοϊού.