Євро-2008 Фрай пропустив, отримавши в першому ж матчі проти збірної Чехії (0:1) на 43-й хвилині серйозну травму.
19 липня2009 року офіційно представлений гравцем швейцарського «Базеля»[1]. Сума трансферу склала 4,25 мільйона євро. Вирішальну роль в переході Фрая в «Базель» зіграло бажання самого футболіста продовжити кар'єру в рідному для себе клубі.
Є найкращим бомбардиром збірної Швейцарії за весь час. 4 листопада2010 року Александр оголосив про завершення кар'єри в збірній. Причиною тому стали безперервні образи з боку фанатів національної збірної[2].
За підсумками сезонів 2010/11 і 2011/12 двічі поспіль ставав найкращим бомбардиром чемпіонату Швейцарії. В середині листопада 2012 року Алекс оголосив про завершення своєї футбольної кар'єри в кінці сезону 2012/13. Причиною стало народження доньки за 2 тижні до цього оголошення.
Після закінчення своєї ігрової кар'єри, 15 квітня2013 року Фрай став спортивним директором «Люцерн»[3]. де працював до кінця 2014 року[4].
2015 року повернувся до «Базеля», у клубній структурі якого став займатися підготовкою юнацьких команд. Влітку 2018 року протягом тижня виконував обов'язки головного тренера основної команди клубу.