Senator Edward Livingston avgick 1831 för att tillträda som USA:s utrikesminister och efterträddes av Waggaman som var motståndare till Andrew Jackson. Waggaman återgick 1835 till arbetet som advokat.
Waggaman avled i skador han ådrog sig i samband med en duell. Han gravsattes på Girod Cemetery i New Orleans. Orten Waggaman har fått sitt namn efter George A. Waggaman.