В 1853 году барон Штиглиц совместно с бароном Фелейзином занялся постройкой частной железной дороги из Петербурга в Петергоф. Вокзал был построен для этой железной дороги и до 1872 года назывался Петергофским. Движение поездов с вокзала открыто 21 июля1857 года. В 1860—1870 годах частная Петергофская железная дорога была соединена новой линией с Красным Селом, а через него по Балтийской железной дороге — с Гатчиной, Нарвой, Ревелем (ныне Таллин) и Балтийским Портом (ныне Палдиски). 19 декабря 1872 года на вокзал прибыл первый поезд из Ревеля, с этого времени вокзал стал называться Балтийским.
Современное здание вокзала построено в 1855—1858 годах архитектором А. И. Кракау. Прототипом вокзала послужил Восточный вокзал в Париже.
По бокам здания располагались двухэтажные флигели, левый предназначался для императорской семьи.
Перроны имеют стеклянное перекрытие, в витражефасада установлены действующие поныне часы «Павел Буре».
В 1931—1932 годах Балтийский вокзал реконструирован.
Из-под купола здания убраны пути, боковые входы закрыты, центральный вход сделан на месте трехарочных окон.
Железнодорожная ветка вокзала была электрифицирована первой в Ленинграде и в январе 1933 года на станцию Лигово выехал пробный электропоезд. С того же 1933 года Балтийский вокзал принимает и отправляет только пригородные поезда и по объёму пассажиропотока пригородного сообщения входит в число крупнейших в России.
К левому крылу пристроен наземный вестибюль станции метро«Балтийская» (1955), закрывший несколько витражей светового зала[3] и нарушивший симметрию фасада.
В начале 2000-х годов вокзал был отреставрирован и в апреле 2003 года оснащён автоматической системой контроля оплаты проезда (турникетами).
До 13 декабря 2014 года вокзал не обслуживал поезда дальнего следования, только зимой 2009—2010 годов в связи со снежными заносами части путей Витебского вокзала некоторые поезда дальнего следования прибывали на Балтийский вокзал (например, из Риги). С 14 декабря 2014 года по 14 февраля 2015 года вокзал обслуживал поезд дальнего следования Санкт-Петербург—Таллин. С 4 августа 2018 года вокзал стал обслуживать поезда дальнего следования Санкт-Петербург — Псков, Санкт-Петербург — Печоры-Псковские.
11 ноября2002 года около 10:30 электричка, проходившая ремонт в депо, неожиданно тронулась с места, набрала ход и на скорости 41 км/ч сошла с вокзального окончания рельсов, разрушив имевшийся отбойник, и выскочила вверх двумя первыми вагонами на распределительную пассажирскую площадь перед зданием вокзала. В результате происшествия под колёсами поезда на площади погибли четыре человека и пострадали ещё девять. В момент катастрофы пассажиров в самом поезде не было. В связи с происшествием вокзал был закрыт, на это время пригородные электропоезда отправлялись со станций Броневая и Ленинский Проспект[4].
По версии следствия, по поручению старшего мастера Бугаев и Шапичев отправились проводить подготовительные работы в электричке перед её обкаткой. Во время работы Бугаев заметил сломанный манометр и отсутствующий пульт радиостанции. Никого не предупредив, не поставив электричку на тормоз, Бугаев отправился в депо доложить об обнаруженных неисправностях. Шапичев же продолжал работу. По версии следствия, он соединил два провода не предусмотренной схемой перемычкой, замкнув цепь, в результате чего электропоезд с 10 вагонами двинулся к платформе, набирая скорость. Около 10 часов поезд со скоростью 41 километр в час выехал на распределительную площадку между платформами и зданием вокзала[5].
Виновными судом были признаны слесарь по ремонту подвижного состава локомотивного депо ТЧ-15 станции «Санкт-Петербург — Балтийская» Н. Шапичев и машинист Н. Бугаев, получившие 2 и 3 года колонии-поселения соответственно[6].
Современность
С 1 июля2007 года пассажирские перевозки по направлениям с Балтийского вокзала осуществляет ОАО «Северо-Западная пригородная пассажирская компания»[7]. Каждый час услугами Балтийского вокзала пользуются около 2,8 тыс. человек. По объёму пригородных пассажирских перевозок занимает второе место среди вокзалов Санкт-Петербурга и одно из первых в России. По состоянию на 2018 год вокзал обслуживает следующие направления:
РГИА, ф. 273, оп. 6, д. 1700. «По вопросу об объединении петербургских станций Балтийской и Варшавской железных дорог». 1908 г.
РГИА, ф. 1158, оп. 1, д. 65. «Об отпуске средств на переустройство петербургских станций Северо-Западных ж. д. и на введение на дорогах электрической тяги». 1916 г.