La Kup Bosne i Hercegovine 2000-2001 è stata la prima edizione della coppa nazionale della Bosnia Erzegovina. È iniziata il 2 dicembre 2000 come Coppa della Federazione di Bosnia ed Erzegovina (con solo le squadre bosgnacche e croate, ovvero quelle della Federazione di Bosnia ed Erzegovina), ma a "metà strada" si sono aggiunte le squadre della Repubblica Srpska e quindi per la prima volta il torneo ha coinvolto tutte le tre etnie della nazione.
La coppa è stata vinta dallo Željezničar, al suo primo titolo.
Il torneo avrebbe dovuto svolgersi con la consueta formula ad eliminazione diretta con la partecipazione delle squadre aderenti alla N/FSBiH ma il 31 gennaio 2001 la Federazione calcistica della Repubblica Serba comunicò che fu raggiunto l'accordo per far giocare quattro delle propri club alla competizione. Venne così effettuato un turno intermedio tra gli ottavi ed i quarti di finale con la coppa che proseguì ad eliminazione diretta.
Nel turno intermedio entrano 4 squadre dalla Kup Republike Srpske:
Il 31 gennaio 2001 è stato annunciato che le 4 semifinaliste della Kup Republike Srpske si sarebbero aggregate alla coppa. Quindi, invece di proseguire con la disputa dei quarti di finale (l'andata era in programma il 24 febbraio[2]), si è decisa l'effettuazione di un turno intermedio fra le quattro squadre serbe (Boksit, Radnik, Kozara ed Omladinac) e quattro fra le otto della Federazione BiH che avevano superato gli ottavi di finale (Posušje, Čelik, Olimpik e Sarajevo).
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