La Cupa Moldovei 2000-2001 è stata la decima edizione della coppa nazionale disputata in Moldavia tra il 24 ottobre 2000 e il 23 maggio 2001. Vincitore della competizione è stato lo Sheriff Tiraspol, al suo secondo titolo.
Ottavi di finale
Gli incontri di andata si sono disputati il 24 ottobre mentre quelli di ritorno l'8 novembre 2000.