1 липня 2011 року він підписав контракт з командою «Падерборн 07».[4]
24 червня 2012 року його було оголшено новим головним тренером «Ред Булл Зальцбург».[5] На своєму другому році перебування на чолі команди, Шмідт привів клуб до їхнього другого чемпіонства за три роки. Команда також пробилася до 1/8 фіналу розіграшу Ліги Європи, програвши «Базелю».
25 квітня 2014 року «Баєр» переманив Шмідта до своїх лав, підписавши з ним контракт головного тренера.[6] 5 березня 2017 року Шмідта було звільнено після серії невдалих ігор.[7]
У червні 2017 року підписав контракт на два з половиною роки з китайським клубом «Бейцзин Гоань».[8][9]
В березні 2020 року Рогер Шмідт підписав 2-річний контракт з голландським ПСВ[10], до роботи з яким він приступив влітку того ж року. За два роки в клубі завоював Кубок та Суперкубок Нідерландів.
18 травня 2022 року підписав дворічний контракт з португальською «Бенфікою».[11]
.png)
