Participou ativamente do movimento Diretas Já, à época filiado ao MDB (1972/1994). Após a redemocratização, foi filiado ao PCB, e ajudou a fundar o PPS, ao qual pertenceu até março de 2018.[10]
Em 1996, foi nomeado ministro extraordinário de Política Fundiária por Fernando Henrique Cardoso. Admitido por FHC ainda em 1995 à Ordem do Mérito Militar no grau de Comendador especial, foi promovido pelo mesmo em março de 1999 ao grau de Grande-Oficial.[11][1] Em novembro do mesmo ano, seu cargo foi normatizado como ministério, recebendo o nome de Ministério do Desenvolvimento Agrário, pelo qual exerceu até 2002.
Em 18 de outubro de 2016 uma edição extra do Diário Oficial da União publica o decreto de exoneração de Jungmann.[14] Mas a exoneração foi por apenas por um dia para que assumisse o cargo de deputado federal.[15] Em nota, Ministério da Defesa esclareceu, "que o ministro Raul Jungmann, suplente de Deputado Federal pelo Estado de Pernambuco, foi “exonerado” pelo presidente da República em exercício, deputado Rodrigo Maia, para reassumir o posto de Deputado Federal de acordo com o artigo 56 da Constituição Federal e artigo 241 do Regimento Interno da Câmara dos Deputados. Isso ocorre porque, caso contrário, o ministro Raul Jungmann perderia a vaga de suplente do deputado federal Mendonça Filho, hoje ministro de Estado da Educação".[16]
Com a abertura do processo de impeachment de Dilma Rousseff, pelo Senado Federal, assumiu interinamente o governo até a conclusão do processo, em 31 de agosto de 2016, sendo empossado definitivamente como presidente.
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