Bei den Kongresswahlen des Jahres 2010 wurde er als Kandidat seiner Partei im 13. Wahlbezirk von Michigan in das US-Repräsentantenhaus in Washington gewählt, wo er am 3. Januar 2011 die Nachfolge von Carolyn Cheeks Kilpatrick antrat. Die vormalige langjährige Abgeordnete hatte er in der Primary der Demokraten mit 47 Prozent der Stimmen besiegt; Kilpatrick war auf 41 Prozent gekommen. Im Anschluss gelang ihm bei den eigentlichen Wahlen ein ungefährdeter Sieg gegen den Republikaner John Hauler. Damit gehörte er zu den wenigen Demokraten, die bei diesen Wahlen neu in den Kongress einziehen konnten. Im 112. Kongress war Clarke Mitglied im Ausschuss für Innere Sicherheit sowie im Ausschuss für Wissenschaft, Raumfahrt und Technologie. Nach dem turnusgemäßen Neuzuschnitt der Wahlkreise im Gefolge des Zensus 2010 trat Clarke bei den Vorwahlen im neugebildeten 14. Wahlbezirk von Michigan gegen seinen Amts- und Parteikollegen Gary Peters (bisher 13. Bezirk) an und unterlag, sodass seine Amtszeit im Repräsentantenhaus am 3. Januar 2013 endete.
Nachdem sich Peters dafür entschieden hatte, bei der Wahl 2014 für den US-Senat anzutreten, versuchte Clarke sich bei der zeitgleichen Wahl wieder für den 14. Kongresswahlbezirk aufstellen zu lassen, scheiterte jedoch in der Vorwahl der Demokraten am 8. August 2014 gegen Brenda Lawrence.[1]