生物柴油 （英語：Biodiesel ），是用未加工过的或者使用过的植物油 以及动物脂肪通过不同的化学反应 制备出来的一种被认为是環保 的生質燃料 。这种生物燃料可以像柴油 一样使用。[ 1] [ 2]
菜油甘油三酯 之轉酯化反應 生質柴油製程 生产生物柴油分別為酯交换反应 、氢化 裂解 、不使用催化剂的超临界 方法、e-柴油 、高温分解、微乳状液等方法。生物柴油最普遍的制备方法是酯交换反应 。由植物油和脂肪中佔主要成分的甘油三酯 与醇 （一般是甲醇 ）在催化剂 存在下反应，生成脂肪酸酯 。脂肪酸酯的物理和化学性质与柴油非常相近甚至更好。
酯交换反应是将植物油和甲醇 或乙醇 混合，生成脂肪酸酯，即生物柴油。催化剂可以是酸 ，也可以是碱 ，但是由于碱催化的转化率 更高（>98%），若要提高為98%轉化率必需二級反應 以上，通常一級反應 酯化率在98%以下，而且常压 反应，没有中间步骤，对设备的要求也低，因此一般是採用鹼催化反應。
回鍋油 、廢棄食用油轉化
1853年，兩個化學家E達菲（E. Duffy）和J.帕特里克（J. Patrick），第一次試驗成功將植物油 酯交換製造肥皂。[ 7]
西元1876年德國工程師鲁道夫·狄塞尔 （Rudolf Diesel）發明了柴油引擎 ，最初使用花生油 當燃料，但花生油成本太貴，難以與汽油 競爭，後來便使用石化柴油 做為燃料。用油脂 來做為現今柴油引擎的燃料會遇到一個問題，油脂的黏度太高難以噴成細霧狀使用，1990年後開始使用轉脂化技術將高黏度的油脂轉化為低黏度的單鏈 脂肪酸甲酯 ，做為柴油引擎的原料使用，因此各國皆開始利用為加工過的油脂或者是廢棄的油脂經煉成生質柴油。[ 8] [ 9] [ 10] [ 11] [ 12]
生产生物柴油的原料往往根据各地区可以得到的原料种类不同而不同。实际产油效率和技术不同。下面列出了一些国家和地区所採用的主要原料：
从原理上说，未经加工的植物油只能在柴油发动机 裡短期直接使用。这是由于植物油含有饱和度不同的物质而会使柴油发动机上的润滑油 发生聚合 。而且植物油和柴油分子结构不同，这也可能造成雾化不良、燃烧不完全、喷嘴 堵塞等问题。
原料每亩产油效率（收率）引向原料以后的工业化和市场化的可行性，因为产量必须能够供应给整个国家或全世界。以下是现有技术所能够出产的原料效率：
一張貼在
京都市營巴士 車窗上的佈告，說明此車使用生物柴油作為燃料，並鼓勵大家踴躍回收
炸天婦羅 廢油作為原料。
使用生物柴油运行的巴士
老式柴油梅赛德斯因使用生物柴油行驶而广受欢迎
在某些国家，生物柴油比常规柴油便宜
生物柴油一般不是直接作为燃料使用；而是与普通柴油 混合使用。一个公认的经验值是调和20%生物柴油（B20，參見B100 ） 。但是這個比例在使用有毒性成分的生質柴油時，可能會有爭議，例如非食品級的蓖麻油 可能含有蓖麻毒素 ，如果燃燒不完全，可能導致安全性隱憂。因此在台灣採用98:2的低混合比[ 21]
生質柴油另一個環保優勢，是其可降低引擎廢氣排放。生物柴油幾乎「沒有含硫化物 」，排放的廢氣自然也沒有硫化物 。研究顯示如果用20%生質柴油的比例混合的話，柴油引擎NOx 排放會增加2%，但微粒 排放會降低15%，碳氫化合物 排放會降低30%，一氧化碳 的排放會降低20%，硫氧化合物 的排放量會降低20%
如果生質柴油的來源是「回鍋油 」[ 22] （B2合成燃料 ） 、39公噸作為馬路標線用料及機械潤滑油 。[ 23]
一般认为，生物柴油的优点在于可以减少「一氧化碳 等废物」的排放量，而且运输也比普通柴油安全。此外，研究发现，生物柴油的润滑性能很高。有趣的是，调和5%以内可以提高润滑性能，但是如果高于5%，润滑性能却不再增强。
生質柴油在製作時必須將酸價 給控制在0.50mgKOH/g以下，酸價過高會有腐蝕性。
虽然生物柴油的开发作为一种替代能源 被业界看好，但是却鲜有生产商业化的例子。这主要来自植物油的成本。植物油的采购、运输、储存以及提取佔了生物柴油生产的大部分成本。但是也有观点认为，由于生产生物柴油，需要大量的植物油原料，因此势必需要兴建种植园，因而可以带动相关的农业生产。
生物柴油也存在一些技术限制，不适应很多地区。由于它比普通柴油粘度 高，因此在低温下会降低可用性。如同雞湯、紅燒肉放到冰箱冷藏，油脂會凝結成白色黏稠狀，學術上的名詞就叫做「雲化 」（cloud），凝結的溫度則叫做「雲點 」（cloud point）。石油基柴油的雲點大約在攝氏零下15度，而100%生質柴油B100 在攝氏零度時便會開始雲化 ，低溫時很容易堵塞汽車油路 。在冬天 使用生物柴油必须加入添加剂 或者其他的保温措施。而在湿热环境下，长期储存生物柴油还需要考虑到抑制微生物 和细菌 的滋生。
生質柴油另一個劣勢，是B100的蘊含能量比石油基的柴油燃料低11%，最大馬力輸出大約會減少5－7%。但這個差距並不大，如果是使用5%生質柴油更幾乎沒有差別。反而是生質柴油的黏性大於石油基柴油，對燃噴射料系統和引擎元件能提供較好的潤滑性，延長引擎系統壽命。許多車主指定使用B2柴油（2%生質柴油，98%石油基柴油），目的就是在幫助潤滑引擎。而前面提到美國小學生乘坐的這些大豆動力車，則是使用B5到B30的柴油。
為協助生物柴油 的開發，在不少國家（如加拿大 、南韓 等）都會投入生物科技工業園 的發展，透過把相關物料的生產和開發的過程放在一起，以減低生物柴油 的開發成本。
當生物柴油因環境溫度降低到某一程度以下時，油品中一些分子聚集並形成晶體。一旦晶體變得大於可見光 波長的四分之一，油品出現混濁狀態的結晶溫度，通稱為「濁點 」（cloud point，或稱「雲點」）[ 24] 牛油 和棕櫚油 生產的生物柴油分別在16 °C（61 °F）和13 °C（55 °F）時凝結膠化[ 25]
在台灣推廣生質柴油後，由於有車主反應使用B2生質柴油常有油路堵塞及引擎容易熄火的問題，加油站業者亦有油槽沈積物增生、加油機濾器阻塞之案例。
雖然還無法證實與生質柴油的製造或儲運過程還是與氣候或車主保養、加油站業者之管理有關，但2014年5月5日，經濟部 仍決定公告修正「石油煉製業與輸入業銷售國內車用柴油摻配酯類之比率實施期程範圍及方式」，將強制添加生質柴油2%以上之命令，改為車用柴油得摻配酯類。從2014年5月起逐步停供B2生質柴油，以後待問題解決後再重新供應生質柴油。[ 26] [ 27] [ 28]
2014年10月，零售加油站及遊覽車業同聲反對恢復銷售及使用生質柴油，遊覽車公會全聯會則強調，使用近一年時間已發生過500多件行駛中熄火的傷害事件。[ 29] [ 30] [ 31] [ 32]
生物柴油的大量使用會讓許多原本生產食品的農地改種植經濟作物，很可能造成糧價上漲，威脅貧窮人口：而開墾新的農地則會破壞生態 ，而一些研究顯示，開墾新農地所製造的二氧化碳可以提供這塊農地上的作物吸收數十年，換句話說就是在環保上不值得。
可能避免負面效應的方法是採用痲瘋樹 提供油脂（痲瘋樹生產的油脂有毒、不可食用），痲瘋樹不但產油效率佳，而且可以在貧瘠缺水的環境生存，換句話說就是可以利用無法種植作物的土地。但有些人認為就算是採用具有類似痲瘋樹特性的植物生產生質柴油，還是有降低糧食生產的可能性，因為有些第三世界國家的農民會在經濟利益的驅使下，將原本用來種植作物的土地給拿來改種痲瘋樹。另一種可行方案是種植辣木 。
利用廢棄物（例如廢油）生產生物柴油幾乎無環保及道德上的缺點；還可以減少商人使用回鍋油 及地溝油 的誘因。但是回收廢油及廢油內部不純物仍然是問題。
未來可能利用藻類 （如海藻 ）生產生質柴油，以增加生質能源效率，和減輕生質能源可能對農產品價格的影響。但除了技術上還需突破外，由於生產的藻類很可能是基因改造 品種，因此預防這些藻類混入生態系統也是個課題。[ 33] [ 34] [ 35] [ 36]
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