Люфтваффе використовували Ar 96 в своїх льотних школах, ескадрильях перепідготовки та офіцерських училищах для вдосконаленої льотної підготовки, навчання польотам вночі по приладах. У роки Другої світової війни літаки Ar 96 входили до навчальних винищувальних ескадр.
Союзники нацистської Німеччини також активно експлуатували літаки даного типу.
Угорські ВПС отримали 65 літаків Ar 96a і 45 літаків Ar 96b.
основний серійний варіант; фюзеляж подовжений, що дозволило збільшити запас палива; встановлений двигун більшої потужності.
Ar.96B-1
навчально-тренувальний літак без озброєння.
Ar.96B-2
має один кулемет MG 17 калібру 7,92 мм або фото-кінокулемет для навчання стрільбі.
Ar.96C
побудований тільки в передсерійній партії для навчання бомбометання; має прозору панель в підлозі кабіни; оснащений двигуном Argus As 410A-1 потужністю 480 к.с.
Ar 296
через брак матеріалів, перевага була віддана Ar 396
Ar 396a-1
був оснащений двигуном Argus 411
Ar 396a-2
тренувальна версія
Льотно-технічні характеристики
Модифікація: Ar 96b-2
двигун:
тип: Argus As 410A-1
потужність = 465 л.с.
Розмах крила, м = 11,00
Довжина літака, м = 9,10
Висота літака, м = 2,60
Площа крила, кв.м = 17,10
Маса, кг:
порожнього літака = 1259
злітна = 1700
Максимальна швидкість, км / год = 330
Практична стеля, м = 7100
Озброєння: можлива установка 7,92-мм кулемета MG-17