McAlister förlorade demokraternas primärval inför 1926 års guvernörsval mot ämbetsinnehavaren Austin Peay. Två år senare utmanade han Peays efterträdare Henry Hollis Horton i primärvalet utan framgång. Med stöd från kongressledamoten E.H. Crump lyckades McAlister till sist vinna 1932 års guvernörsval. Han omvaldes två år senare. Under den andra mandatperioden som guvernör förlorade McAlister stödet från "Boss" Crump. Han ansåg att möjligheterna till att bli omvald var ytterst små utan Crumps stöd och kandiderade inte till en tredje mandatperiod som guvernör.
McAlisters grav finns på Mount Olivet Cemetery i Nashville.[1]